作者：雪鹰
系统
　　本次战斗系统与一代相同，但LV UP采用与LUNAR2相似的模式，各角色的必杀技、魔法、特技是有熟练度的，其中魔法需要佩带魔石、特技需要装备后方能使用。每次打倒敌人后便可获得特技与魔法的POINT，玩者可以自行将此POINT分配给各角色的必杀技、特技与魔法上，每个招式最多可加到5颗星，星数越多熟练度越高，该招式的威力、成功率以及出招速度也就越大。魔石刚拿到手时不会出现所有的魔法，需要提升其LV方能随之出现新的魔法，每块魔石的最强魔法通常在LV51左右出现。特技之书亦是如此，每本特技之书的最强能力在其等级为LV15左右时出现。使用必杀技会消耗角色的SP，不过SP会随着战斗逐渐回复，但魔法所消耗的MP只有通过道具、回复魔法阵、住宿来回复。
　　本作还加入了指南针指示详细的方向，可以切换令指南针分别指示前进的方向与回去的方向；而在城镇内，指南针还可以指示宿屋、杂货店、以及重要场所的位置，非常便利。
　　另外就是在城镇中可以让角色去碰撞屋内的摆设，而在迷宫中则可挥剑劈开一切特定物体：如蘑菇、花、藤葛等，还可因此找到隐藏在这些物体内的宝物，不过有时则会遇到怪物。
故事
　　遥远的过去，古拉纳斯将希望之光给予人们，人类令希望之光不断扩大，将繁荣握在手中。但是，暗之恶魔巴鲁玛将光从人类身上夺走。古拉纳斯为了守护人类与其展开了一场激战，战事持续了7天7夜，最后古拉纳斯手执神剑“光之佩剑”贯穿了巴鲁玛，也同时在此星球的大地上留下一道不可见底的巨大伤痕。这就是现代被称为“古拉纳悬崖”的大地伤痕，亦是我们所居住的这片大地被称为“被咒大地”的由来。巴鲁玛被封印的同时，天空中出现了一轮红火的月亮，那不详的月亮就象巴鲁玛审视着这个世界一样，窥视着人类心中的欲望，以此为粮食补充其力量，直至复活之日的到来……
　　修萨桑大陆北方小镇卡波附近，一群由女性组成的神官队伍向村民道别后，走向吊桥准备回村。就在这时，一只巨鹰叼着一串炸弹急速飞掠而过，消失在森林的深处。“猎人”里特攀在岩壁上，窥视着下方聚集的怪物们。他的伙伴斯盖——也就是先前的那只鹰，及时在附近扔下炸弹，吸引怪物的注意，里特伺机跳下打倒负责看守的怪物并夺得宝物，然后与斯盖迅速逃离怪物们的包围……当里特将历经艰险夺到宝物交给委托人时，却遭到对方的无礼对待。原来“猎人”以战斗为生、只要有钱就不计较委托的任务，也因此遭到许多人的蔑视。早已习惯他人白眼的里特收下报酬，携斯盖往森林外走去，在与委托人约定的树枝上发现了别人留下的委托书，要里特到卡波村担当神官的护卫。虽然里特对“古拉纳斯教”的神职人员非常感冒，但任务归任务，钱还是要赚的。于是，里特穿过森林，来到了卡波村。
　　刚一进村，就看到一群神官正在与一名歌姬打扮的女孩告别，那些神官似乎要前往附近的黑之森内加尔米亚塔举行某种仪式，而那位歌姬则要待教堂内的祈祷结束后才会由人护送前往加尔米亚塔。里特在旁边听后，猜测出此次的任务大概就是要护送那位歌姬。待众人散去后，里特来到教堂，正撞见那位歌姬艾蕾娜正在唱着颂歌“光之歌”。但是她只唱了一半就停了下来，里特上前出声唤她，令艾蕾娜吓了一跳。里特那不客气的口调引起艾蕾娜的反感，两人一下子就争吵起来。幸好神父卡利乌斯及时走了出来，制止了艾蕾娜，并要里特到宿屋去等他。不一会儿，卡利乌斯来到宿屋，向里特说明委托的事宜。正如里特所猜想的那样，对方要他护送歌姬艾蕾娜平安到达加尔米亚塔，等那里的仪式完毕后再送回卡波村。虽然里特最不擅长与女人及神职人员打交道，但在斯盖的训斥下勉强接受了委托。艾蕾娜也不愿意与恶名昭彰的“猎人”同行，结果亦拗不过神父。满腹牢骚的两人只得就此出发，穿过怪物遍布的黑森林，抵达了加尔米亚塔。
　　在塔门前，先前那些神官早已等候在地，领头的红发女子忒莎催促艾蕾娜和她们进入塔内，举行重要的封印仪式，并吩咐里特在外面等待。因为不知仪式要举行多久，里特便在附近的空地上搭好帐篷休息。今晚正值满月，在红色的巴鲁玛之月映照下，加尔米亚塔显得异常诡异。就在这时，塔内突然传来艾蕾娜的惊呼声，里特赶紧冲入塔内，发现里面突然冒出无数的魔物，一路斩杀过去终于来到塔顶，却见忒莎已经重伤倒地。紧闭的大门无法打开，于是打破旁边的窗子进入主室，但见屋子中央有个奇怪的魔法阵，上面漂浮着一个业已破损的巨大蓝色圆球。而艾蕾娜则在旁边被紫黑色的光所包围，并痛苦地叫着：“不要！黑暗……不要吞噬我！”看到这番情景，里特的脑海中晃过被自己埋藏在内心深处、那痛苦的回忆，他咬牙冲上去救下艾蕾娜。此时紫黑色的烟雾从圆球中渐渐蔓延开来，情急之下，里特抱着失去意识的艾蕾娜从窗口沿着绳索逃出加尔米亚塔。
　　回到森林中，艾蕾娜恢复神智，但她对同伴的死以及自己被巴鲁玛附身一事而恐慌，里特好不容易让她镇静下来，并将其带回卡波村的教会。卡利乌斯神父早已等候在教堂前，他让艾蕾娜去休息后，然后告诉里特在加尔米亚塔内封印着巴鲁玛的碎片之一——巴鲁玛之翼。正因为现在世界中黑暗的力量在逐渐增强，再加上今天又是满月，为了防止巴鲁玛复活的“黑暗之日”来临，他们受命于古拉纳斯教团前往加尔米亚塔加强封印的力量。谁料封印仪式失败，艾蕾娜还被巴鲁玛之翼附身，这样下去她的心会逐渐被黑暗吞噬。解救艾蕾娜的方法大概只有远在桑托海姆法国的法皇塞拉知晓，为此卡利乌斯神父请求里特护送艾蕾娜到桑托海姆法国去，他还拿出教堂供奉的黄金像做为报酬。里特表示要考虑一下，就在这时，外面突然传来喧哗声，两人跑出去一看，有位赤发红衣女子站在喷水池上，而她的背后则长着漆黑的恶魔翅膀！神父立刻怒斥她为恶魔并向其发动攻击，但却被轻而易举地挡回来。里特随口称赞她一句：“没想到你这么可爱，却很强劲呢！”那神秘女子听了大喜，接近里特并告诉他自己的名字为“米蕾妮娅”。接着米蕾妮娅说看到教堂和古拉纳斯的神像不顺眼，甚至要毁灭整个村子，被里特骂为“胸大无脑”而生气起来，两人立刻展开一场激战。最终，里特还是败给了米蕾妮娅，不过对方似乎非常中意他，娇笑着就此离去。
　　次日，里特决定接受神父的委托，带着艾蕾娜踏上漫长的旅途。（村内与每个人再对话一次，可获得特殊道具。以后每个城镇皆是如此，在刚进去时对话一次，等事件结束后再对话一次，会有意外的收获。另外，村人的对话基本上有三种，如果想获得更多的信息，就与每个人对话三次吧！）两人穿过亚诺尔山地，途中宿营时，艾蕾娜再度对自己被附身一事而感到不安，里特不满她那消极的态度，两人又吵了起来，艾蕾娜生气地在帐篷后面和衣而睡。斯盖飞过来责备里特总是不肯说出自己的心里话，里特再度回想到自己的过去然后表示绝对不会让艾蕾娜死去的。他俩的对话都被艾蕾娜偷听到，从而对里特的印象又有不少改观。
　　次日，两人翻过亚诺尔山地后，来到了大陆南方的宿场町阿基路。可是，原本十分热闹的阿基路竟然化为了一片废墟！从守卫兵的口中得知，突然有大批怪物从山洞中涌出来，摧毁了整个城镇，现在不得不封锁道路以保安全。两人只得进入一旁的临时宿屋，打算先过一宿再说。宿屋的主人拜克斯是里特的旧识，原本也是位“猎人”。说话间突然从后面传来争执声，原来有名叫罗安的小孩在逃出阿基路时将母亲的遗物——一个金属项链让怪物夺走了，他恳求一起同行的保镖利佐特等人帮忙，对方不愿冒生命危险而拒绝了他，并让罗安向身为“猎人”的里特寻求帮助。里特因为已经有艾蕾娜的任务在身，拒绝了罗安的委托并告戒他遗物虽然重要，但还是保命要紧。罗安失望地离开后，艾蕾娜吃着果子吃醉了，里特只好扶她回房休息。回到自己的房间后，里特和斯盖商量，打算在今晚去山洞消灭魔物，这样既可令道路开通，又可替罗安拿回项链。正想付诸于行动时，米蕾妮娅突然出现并要里特陪她玩，好在此时利佐特急忙跑来敲门并告诉里特，罗安独自一人去了怪物的巢穴。于是，里特与米蕾妮娅一同前往城镇内的狄拉姆山洞。
　　进入山洞后不久，可以看到一只可爱的小动物卡罗，只要喂它三颗“泡芙的果实”后，它就会趴在里特的肩上一起行走，但是只要一出洞窟卡罗就会离去（对剧情没有丝毫影响，纯粹是好玩而已）。山洞中有些地方要开启水闸才能令新的道路出现。走了没多久，里特便找到了被怪物包围的罗安，三人继续前行至洞窟的深处，找到怪物的首领并将其击倒、取回了罗安的手镯。走出山洞业已天光大亮，米蕾妮娅说了句“艾蕾娜就交给你了”，然后全身被光团所笼罩，光消退后，出现在原地的竟是艾蕾娜！清醒后的艾蕾娜对于之前发生的事情完全没有印象，当她知道米蕾妮娅就是潜伏在自己心中的巴鲁玛之翼后，受到很大的打击。但是罗安却对米蕾妮娅抱有好感，认为她不是坏人。三人回到宿屋，罗安决定与里特他们同行。稍事休息后，里特他们告别了拜克斯、利佐特等人，穿过阿基路，进入贝库原野。当来到原野3时，展现在众人面前的是深不可见底的“古拉纳悬崖”。从未外出旅行的艾蕾娜对此感到非常新奇，询问里特越过“古拉纳悬崖”的方法，原来是要到附近的交易都市利里格去搭乘空气船。走了一天，三人也累了，便在峡谷附近的空地上搭起帐篷休息。次日清晨，里特他们刚起床，突然有一兽人来袭，一场激战过后，大家终于明白这是误会。兽人马雷古一直在追踪毁灭他们村庄的魔人梅尔菲斯，从里特身上他嗅到与梅尔菲斯相似的味道，故而袭击众人。里特一听“梅尔菲斯”的名字，立刻激动起来，追问马雷古是否知晓此人的下落，并说自己也在追寻梅尔菲斯，还邀请马雷古加入队伍中。但马雷古想独自行动，便与众人告别。待马雷古走后，艾蕾娜问里特“梅尔菲斯究竟是何许人也？”，里特满腹心事地回答道：“那是我的哥哥……” 艾蕾娜心怀着疑问，随着里特来到了交易都市利里格。刚进城镇，就看到有一家人聚在一旁，争论着要离开这里，而城内又笼罩着沉闷的气氛。上前向其询问是否能搭乘空气船一事，得到的回答却是要到明天才能开动，而且现在的空气船是不载人只送货的。三人只得先到宿屋住宿一晚，当夜的晚餐非常难吃，里特他们胃口大倒。次日，饥肠辘辘的三人撞见一位技师的孩子，被他带到家中见过其父母，方知这里中了诅咒，人们丧失了味觉不能吃普通的事物，而所有的食物与经济皆被市长葛旦所控制。但是大多数人又不愿离开这个富饶的都市，所以情愿吃着难以下咽的东西也要继续留在此地干活。里特他们去见过葛旦后获知要交纳10000大洋，方可在明天搭乘空气船。艾蕾娜便提议到教会找神父询问诅咒的原因，结果被告知这里是受古拉纳斯祝福的城镇，因为原本是建立在遗迹上的，但是无止尽的开发令遗迹的柱子不断腐蚀倒塌，所以才会遭到诅咒。出得教会，再度遇到马雷古，他说嗅到了破灭之力的味道，于是加入队伍中与里特他们前往城最高大的柱子处调查，找到入口进入大空洞内。（事先提醒一下，各位不要给马雷古的必杀技提升太多，基本上只要将他的第一项必杀技修炼至MIX即可，否则日后定会后悔浪费了宝贵的特技POINT。）在洞的深处，众人发现了业已破损的巴鲁玛碎片封印。接着，“巴鲁玛之舌”出现在里特他们面前并发起了攻击。这算是进入游戏起后的第一次BIG BOSS战，其实很容易解决，只要将每位角色的第一项必杀技提升熟练度，这样每当右下角的行动槽内敌人进入行动区后，让角色使用具有延迟敌人行动效果的第一项必杀技，就能令其行动滞后，而将主导权握在我方手中。再让具备全体攻击魔法的伙伴不断地施以全范围的打击，并辅以其他同伴的集中攻击，将敌人依次解决即可。击倒了巴鲁玛之舌后，发现原来是市长葛旦被其附身，米蕾妮娅吸收了“舌”的力量同时，将葛旦的心也同时抹消，成为了一个植物人。回到利里格市，市民们又恢复了味觉，空气船亦再度开通，里特他们搭乘着前往大陆的东部。
　　坐在空气船内，突然飘过一阵奇异的气息，艾蕾娜突然惊叫起来，接着空气船猛烈地摇晃并在紫黑色风暴中飞了出去，落在了东大陆的雪山中。里特他们醒来后，发现失去了艾蕾娜的身影，此时艾蕾娜因为米蕾妮娅的呼唤而清醒过来。她走到冰成镜子般的石头前，从中看到米蕾妮娅的影象投射，米蕾妮娅说幸亏自己救了她，但艾蕾娜总是对米蕾妮娅抱有强烈的厌恶感。与里特他们汇合后，众人试图走出被冰雪笼罩的露米尔森林，穿过数个洞穴后，终于接近森林的边缘。此时，周围突然弥漫起白色的浓雾，接着众人发现来到了一个盛开着鲜花的大花园中。在花园中央的大树下，站着一位绿发的小女孩，她向大家解释这里乃是梦之花园，是能让大家忘却不愉快的事情、幸福地生活着的理想地。说着，旁边飞过来几个精灵的光点，围绕着小女孩。艾蕾娜上前与女孩攀谈，发现她的眼睛似乎看不见。女孩又说这个地方很适合艾蕾娜居住，因为她的内心是如此希望着，末了还说：“请不要吃我。”然后就消失不见了。众人莫名其妙，只得离开花园，发现森林中的道路有所改变了。虽然觉得事有蹊跷，但如今还是早点赶路，尽快到附近的米路姆村休息。
　　刚走进村内，村民看见艾蕾娜就兴奋地欢呼“神官来了！”，还急忙找来了村长。一问之下方知这个村子里发生了数人沉睡不起的事件，大家怀疑此乃诅咒，便向桑托海姆法国求救，对方同意派遣神官过来祛除恶魔，但是至今仍未到达，等得心焦的村民们便误以为艾蕾娜就是法国派来的神官。心地善良的艾蕾娜听后，有心想要替村民们解决此事件，里特便提醒她必须尽快前往法国，还是不要插手为妙。众人先到宿屋休息，宿屋的女主人伊莉娜最初也将艾蕾娜当作法国派遣的神官，因为她的儿子尼哥鲁是第一个沉睡的人。接着伊莉娜应众人的要求，带他们去寝室探望尼哥鲁的情况。然后叹息儿子那副幸福的睡脸，宛若在梦之花园与妖精嬉戏般。里特他们一听此话，立刻说到先前曾在森林里看到梦之花园。伊莉娜大为惊讶，因为梦之花园只是孩子们之间流传的童话而已。当艾蕾娜说出还在梦之花园碰到一位右眼有伤疤的女孩时，伊莉娜立刻脸色大变，告诉众人那是魔女桑德拉的女儿爱拉，并一口咬定这一事件乃是爱拉所为。艾蕾娜对此不以为然，大家遂至村中靠山脚的小木屋去找桑德拉。正好在门前再度遇到了爱拉，发现她的眼睛又看得见了。此时桑德拉飞奔过来，以为里特他们要欺负自己的女儿。艾蕾娜说明情况后，桑德拉带众人进入屋中并告诉他们爱拉的眼睛是靠自己不断地祈祷、再加上敷用草药治好的。但是村人却将此视为恶魔的力量，骂她为魔女，还欺负爱拉。接着艾蕾娜问爱拉，为何在梦之花园里说“不要吃我”，爱拉刚想回答时突然露出恐惧的神色，说有非常恐怖的人过来了。众人听后急忙出门查看，正听到村民奔走相告，说是法国派遣的神官终于来到了。里特他们走到村口一看，所谓的神官竟然是异端审问官的祭司长茜蕾妮及其率领的圣堂骑士团！茜蕾妮下令封锁整个村子，还表示如果发现被恶魔占据心灵的人要杀无赦！一旁的罗安便想起以前也曾有个村庄就这样被圣堂骑士团全部歼灭、烧成废墟。艾蕾娜上前向茜蕾妮说明自己是要前往法国向塞拉法皇报告封印仪式的情况，但茜蕾妮不肯让他们通过，说一定要等找到恶魔之后才能解除封锁。众人无奈之下，只得先回宿屋休息一晚。
　　入夜，里特又做到了不详的梦，那是过去悲伤记忆的再现。里特惊醒后发觉周围弥漫着不安定的气氛，走到窗前向外张望，却看到一个巨大的眼球怪物飞过。此时其他三人也跑了进来，都说做了噩梦并发现了眼球怪物。众人急忙赶至伊莉娜的房间，发现业已晚了一步，伊莉娜已经陷入了无法清醒的梦境中。靠斯盖的指引，里特他们追着眼球来到了桑德拉小屋附近的山洞中，并在地下道的深处发现了破裂的巴鲁玛碎片的封印！接着遭到三个巨大眼球的攻击，消灭了它们后里特察觉到这只是小喽罗而非真正的“巴鲁玛之眼”，艾蕾娜还在地上发现了一朵花。走出洞窟，听到村民说大家都聚集在公民馆，于是过去看个究竟，再度撞见了茜蕾妮。艾蕾娜对她那种斩尽杀绝的作风非常反感，决心一定要赶在茜蕾妮前面找到被恶魔附身的人并拯救她。里特提出再去地下道查看有什么线索，众人便往那里走去，看到爱拉站在小屋前，还说要带艾蕾娜到梦之花园去。众人跟着她进入小屋后面的储藏室，并从地板上的大洞跳下，发觉下面竟然就是封印之地！与此同时，爱拉右眼的伤疤处突然冒出一只眼睛来，原来被“巴鲁玛之眼”附身的人正是她！爱拉说自己只是想带大家到无忧无虑的世界中去，并没有恶意，但为何会遭到大家的厌恶？正在说话间，爱拉突然感应到什么，叫了声“妈妈”就离开了。众人赶紧回到地上，看到桑德拉被圣堂骑士围着，茜蕾妮逼问爱拉的下落，还说要制裁被恶魔附身的母女俩。桑德拉苦苦哀求，说一切都与女儿毫无关系，但茜蕾妮根本不为所动，甚至还煽动被恐惧笼罩的村民们一起逼迫桑德拉。就在这时，爱拉跑了过来，大家看到她额头上的眼睛都感到害怕，连桑德拉都不例外。看穿别人内心的爱拉对此倍感痛苦，茜蕾妮乘机下令诛杀爱拉，里特及时赶到阻止了圣堂骑士。艾蕾娜上前想安慰爱拉，却被她打倒在地，爱拉哭喊着消失了。茜蕾妮愤愤地率着圣堂骑士离开，艾蕾娜变成了米蕾妮娅，说爱拉逃到了自己的内心世界。众人出村由露米尔森林进入梦之花园，米蕾妮娅打开通往爱拉内心世界的道路，在那孤独空间的深处找到了她。爱拉对于大家、甚至母亲想要杀她而感到绝望，她已听不见里特他们的解释，与巴鲁玛之眼完全同化，并意图杀死众人。这一战略有些难度，因为除了巴鲁玛之眼的三个部分外，还有三个小眼球，因此要善用具备“CANCEL”效果的第一项必杀技，再辅以全体攻击魔法（雷魔法特别有效）。另外还需注意的是巴鲁玛之眼具有咒缚效果，会令味方成员无法动弹。先集中消灭旁边的小眼球，然后再收拾巴鲁玛之眼会比较轻松些。
　　好不容易击败了巴鲁玛之眼，从内心世界返回到梦之花园。米蕾妮娅正打算吸收爱拉，但遭到里特的制止。争论间，桑德拉跑了过来，向爱拉道歉。爱拉原谅了母亲，并请求米蕾妮娅赶快结束她的痛苦，否则她会继续给母亲以及大家添麻烦的。无可奈何之下，里特只得让米蕾妮娅吸收巴鲁玛之眼，令爱拉变成了失去心灵、一直沉睡的植物人。绚丽的梦之花园瞬间枯萎下来，而那些变为精灵的村人们的心也都飘回村中。看到桑德拉悲痛的样子，米蕾妮娅便说一旁残留着的白色花朵是爱拉的心之碎片，如果让这花园再度开满鲜花的话，爱拉的心或许就能回来了。桑德拉一听立刻表示一定要让花园恢复原状，里特见此感受到米蕾妮娅和自己很相似，都是不肯直率地表露自己善意的人。回到米路姆村，虽然事件已获得解决，村人们也改变了对桑德拉和爱拉的偏见，但茜蕾妮却执意要带走桑德拉母女去审判，还要抓庇护“恶魔”的里特，结果在艾蕾娜与村民们的求情下，方肯作罢，但临走时威胁艾蕾娜说要将她的言行汇报给塞拉法皇。（米蕾妮娅现在可以使用“咒缚之瞳”的必杀技，此招用在BOSS战中特别有效，可以令其长时间无法动弹。）
　　里特一行与米路姆村的村民们告别后，翻越过桑托海姆山地，终于抵达了目的地——古拉纳斯教的总本山“桑托海姆法国”。里特等人都为艾蕾娜感到高兴，但她却有所犹豫而决定先到宿屋休息一晚，明天再去见法皇。众人正在宿屋内吃晚饭时，有一位神官跑进来通知艾蕾娜，要她立刻去见法皇塞拉。待艾蕾娜离去后，里特他们商量之后的去向，马雷古决定与里特一同去追寻梅尔菲斯的下落。这时，先前的神官再度回来，告诉里特法皇要召见他们。三人来到大圣堂，里特独自一人进入谒见间，马雷古与罗安则到图书室查询资料。走进谒见间，正撞见艾蕾娜与其他两名歌姬在高唱“光之歌”。歌声渐隐，一群恐慌的神官纷纷向法皇塞拉询问避免“黑暗之日”的方法，塞拉示意众人镇静下来，并表示光之神古拉纳斯一定会守护大家的，所以要心无邪念、与巴鲁玛做抗争。他还叮嘱茜蕾妮在祛除恶魔时不可做得太过火。待神官们离去后，塞拉将里特招到自己的房间，说明现在对抗巴鲁玛的唯一方法就是光之神古拉纳斯使用过的神剑“光之佩剑”。而此剑亦是拯救艾蕾娜的关键，因为他也无法拔除其体内的巴鲁玛之翼。至于神剑的下落，只有古书上记载的一些话：“神剑贯穿巴鲁玛的身体”“与暗之军势长眠于黑暗的地底”。塞拉体谅地说可以让里特考虑一晚，稍后再给他答复。回到图书室找到马雷古与罗安后，里特向两人说明此事，罗安听到“暗之民”后若有所思。当晚，三人在大圣堂的客房内住下，当巴鲁玛之月高挂在夜空中时，米蕾妮娅飞舞在大圣堂的屋顶上……被吵醒的里特赶到右边的祈祷间找到了米蕾妮娅，问她究竟意欲如何？米蕾妮娅回答说因为喜欢里特，所以要和他在一起，但是里特总是想着艾蕾娜的事情，这令她很生气……
　　次日，里特见过法皇塞拉，答应与艾蕾娜一同去寻找神剑。反观艾蕾娜却有些心事重重的样子，而罗安则说他的故乡萨拉姆王国有着“暗之民”的线索。于是众人决定出发前往罗安的故乡，穿过拉乌鲁丘陵，便来到了萨拉姆王国。这是个充满活力的临海国家，各种各样的民族汇聚于此，以商业为中心非常富饶。罗安告诉里特，萨拉姆王国之民便是以前帮助巴鲁玛对抗光神古拉纳斯的暗之民的后裔！当然，现在的人民早已忘却祖先的事情，快乐地生活着。大家在城中转悠了一圈，获悉明天要在广场召开建国纪念祭，王国中的男子都要到王宫去，国王有重大消息要发表，似乎是关于在城的地下找到了什么宝物。罗安一听此事，立刻脸色大变，表示要到自己家去看一下。里特与艾蕾娜则根据宿屋主人提供的消息，在第二天到广场一角的情报屋打探神剑的下落。起初情报屋的男子亨布尔不愿告诉里特，于是里特就按宿屋主人所说，与艾蕾娜假装情侣的样子，亨布尔立刻生气起来，带两人进入屋内要与里特比腕力，还说若是他输了就要放弃艾蕾娜。比赛方法很简单，按R键是使力，不断敲击A键则是补充持久力，若持久力跌为零便告输。这次比赛是会强制里特赢得胜利的，结果亨布尔却说他根本就不知道神剑的事情。两人失望地离开，艾蕾娜走了一会儿感到累了，就在长椅上坐下，要里特买果汁给她喝。里特跑到附近的冷饮店，结果那里都卖些奇怪的饮品，只有最后一个空白的选项才是普通的果汁。待他回到长椅处，却发现艾蕾娜已经变成了米蕾妮娅。米蕾妮娅强挽着里特要和他约会，最后里特拗不过她便与其一同在广场的各个摊位游玩起来。（掰手腕的MINI GAME可以获得各种宝贵的道具，不过其难度会随着游玩的次数提高的。）最后在被誉为“歌舞之民”的猫族摊位前停了下来，欣赏着对方那充满活力的舞蹈。就在这时，罗安与马雷古神色紧张地跑了过来。罗安要大家赶快潜入王宫内，说在那里有大事发生，而马雷古则说嗅到了梅尔菲斯的味道。
　　按照罗安的指示，里特他们搭乘附近的小船，来到了王宫的后院。在那里有两名士兵守卫着，看到罗安后就称其为王子，还说麦诺利正等着他。罗安向众人说明，其实自己乃是这个国家的王子，他们一直守护着王宫地下的暗之扉，那里是封印过去神魔之战遗留下来的暗之军势力量，而母亲的遗物“手镯”是打开暗之扉的钥匙。但是如今国王竟然想要打开暗之扉，所以罗安寻求里特他们帮助，一同阻止父亲。四人进入地下道，利用水门的机关不断前行，最后来到宫殿内右上角的封魔部屋，见过封魔士麦诺利。当获知国王是受到一神秘人的挑唆时，马雷古断定那人必定是魔人梅尔菲斯。罗安决定找到父亲并说服他，于是众人来到楼上的办公室见过国王，然而对方丝毫不理会罗安的劝说，说要利用暗之扉的力量令王国兴旺。待国王走后，罗安痛心地撕下一旁的旗帜，露出里面印有巴鲁玛纹章的国旗，说正因为国民不愿正视黑暗的过去，以致无法从心里摆脱“暗之民”的阴影。此时，地底突然传来巨响，罗安对此大为惊讶，因为暗之扉的钥匙在自己手里，按理说是无法解开封印的。众人急忙回到封魔部屋，却只见麦诺利的尸体以及打开了的暗之扉！进入其中，发现里面乃是一巨大的机械工厂！穿越过无数的管子，终于来到中央制御室内。突然出现一机械人偶将众人视为敌人，并化身为“巴鲁玛之爪”袭击过来。这一战非常容易，敌人并不是很强，即便没有刻意练级亦可轻松取胜。战斗胜利后，米蕾妮娅吸收了巴鲁玛之爪。自己一族拼命守护的东西不过是暗之军势生产战斗用的机械人偶的工厂，罗安对此异常气愤也感到祖先的愚蠢。在他的奋力敲击下，工厂的制御装置开始暴走，整个工厂不断地发生爆炸塌方。众人急忙逃离此地，马雷古看那人偶挺可怜的便将其一同带走。
　　回到封魔部屋，人偶逖奥清醒过来，要马雷古下命令给她，马雷古告诉她现在已经自由了，可以不必听别人的命令而自己行动。但是失去心灵的逖奥不明白自由的意思，只是呆站在原地不动。此时里特他们急于寻找罪魁祸首梅尔菲斯，无暇理睬她。众人来到楼上的办公室，就听到国王的惨叫，冲进去一看正撞见魔人梅尔菲斯。里特质问他为何要那样做，梅尔菲斯回答说力量就是一切，所谓的梦想全都是空话而已。明白已经无法与“巴鲁玛之角”的梅尔菲斯沟通后，里特他们全力攻向对方，但是却被轻易地打败，此时逖奥赶至并出手阻止梅尔菲斯。梅尔菲斯见此情景，便说要里特到他们的故乡剑士之岛去，在那里与他彻底地做个了断。待梅尔菲斯离去后，罗安决定继任王位，并向国民们发表演说。说明萨拉姆国原本是暗之民的末裔，这是不可回避的事实，但是大家并非巴鲁玛的道具和棋子，有着自己的意志，所以更应该正视自己，并在真正的国旗下找到新的骄傲。罗安的演说获得国民们的一致赞同，虽然部分人抱有一丝忧虑，但还是对王国的未来充满着信心。因为罗安要留下来管理国家，里特他们便与其告别，走出王宫时被逖奥拦住，她说要跟着主人马雷古，马雷古便要里特让她一起同行，在旅行中或许能让逖奥渐渐找到人类的心吧？
　　四人来到港口找到巴卡拉船长，搭乘他的船50/50号，前往卡米尔海北面的浮岛“剑士之岛”。不过因为需要越过“古拉纳悬崖”，所以船长让马雷古帮忙不断地给气泵打气。艾蕾娜不断地询问里特的故乡是什么样子，究竟过去与梅尔菲斯之间发生了什么事情，但是里特总是避而不谈，只告诉她剑士之岛上侍奉着御神体，那里的人以寻求正义之心、磨练剑技，成为理想的剑士为志向。过了一会儿，艾蕾娜极度晕船，于是里特便央求船长暂时到附近靠一下岸，让艾蕾娜在岸上休息一晚。 50/50号在西西鲁岩礁处靠岸，众人发现岛上有不少巨大的蛋。入夜，里特说出自己的双亲早逝，与哥哥梅尔菲斯相依为命，后来被村长收养，其它事情里特最终还是没能说出来。当大家熟睡后，里特找到在岸边眺望大海的艾蕾娜，她向里特述说自己心中的恐惧，大海虽然美丽，但当她看到水中巴鲁玛的倒影时，心情立刻阴郁下来。里特便抓起一颗石子，说让巴鲁玛之月立刻消失，然后投下石子令水波扩散，倒影破碎开来。艾蕾娜的心情有所好转，笑着承认那真正的月亮是不可能消失的，所以自己也不能逃避。
　　次日，众人醒来后发现从岩壁及蛋中爬出许多蝎子，而且因为涨潮，退路全被淹没了。于是大家一边击退蝎子等怪物的袭击，一边寻找新的道路。终于在打倒为首的两只巨大蝎子后，回到50/50号。巴卡拉船长说正值起风，可以越过“古拉纳悬崖”了。接着他把气泵中的空气注入船帆内，然后催促众人躲到船舱内，里特惊讶地问他那么掌舵怎么办？巴卡拉笑着回答就让船顺风自己航行，运气好的话自然能飞越过古拉纳悬崖，所以这艘船的名字叫50/50，也就是一半运气的意思。但见50/50号张起巨大的风帆，在强烈海风的推动下，急冲向古拉纳悬崖的另一端，然而却因风势减弱，突然向无底的深渊坠落下去，众人的惊呼声中，自古拉纳悬崖下方卷起一阵上升气流，50/50号立刻被托起，翩然飞向古拉纳悬崖的对岸，成功地降落下来！大家终于松了口气，接着航行了没多久，便可遥望到剑士之岛了。
　　踏上故乡的土地，里特不禁感慨万千，然而当他们走进剑士之村加兰时，村人们看到里特却露出厌恶的神色，还斥骂他为“瘟神”并要求里特立刻出村。艾蕾娜想为里特打抱不平，却被他制止了，里特告诉村人梅尔菲斯将会来此，而自己是要来杀梅尔菲斯的，所以一旦完事之后自会立即离开这座岛。村人们听到梅尔菲斯的名字后立刻恐慌起来，勉强同意里特他们在此住宿一晚。众人在村中转悠一圈，在墓地树立着一排排的墓碑，都是被梅尔菲斯杀害的村民，其中还包括他的未婚妻莉娜。接着来到里特的家门前，却见大门已经被木条封住，里特过去的好友格达走了过来，举剑指着里特说他根本没有资格打倒梅尔菲斯，因为当初他抛下大家逃走了。里特接受了格达的挑战，向他展示自己的实力，然后发誓自己一定会与梅尔菲斯做一个了断！艾蕾娜见到村民们苛刻地对待里特，深感不平，同时亦非常想了解过去究竟发生了什么事情，但是里特总是不肯述说自己的过去。当夜在宿屋中休息时，斯盖飞到艾蕾娜房间的窗口下，偷偷告诉她过去这里发生的事情。
　　这个岛上聚集着追求剑道、磨练自己剑技的年轻人，每个人都想成为理想的剑士并为此而努力。该岛上还供奉着只有世界最高剑士才能碰触的神剑，也就是御神体。在年轻一代中梅尔菲斯是最杰出的剑士，亦是大家憧憬的对象，他还与村长的女儿莉娜订下了婚约。对于里特来说，梅尔菲斯是他所景仰的哥哥，而莉娜则是姐姐般的存在。有一天，岛上刮起了前所未有的暴风雨，还从祭坛处传来了地鸣。为了让御神体安静下来，莉娜独自一人前往祭坛祈祷，但是……谁也不知道在她身上究竟发生了什么事，只知她再也没有回来，并且暴风雨与地震越来越猛烈。村长组织了一队年青剑士，以梅尔菲斯为中心，前去寻找莉娜……里特偷偷地跟在后面追寻兄长的影姿，然而，他所看到的是山崩中有诸多巨大的尖角从山体中刺出……接着是数名搜索队员的尸体，以及雷光中梅尔菲斯一剑刺穿莉娜的情景！地震平息后，整座山布满了紫色的黏液，树木全部枯死，最后大家发现莉娜被梅尔菲斯的剑钉在大地上……“夺走御神体的男人”“杀人犯”，众人这样咒骂着梅尔菲斯，并迁怒于身为弟弟的里特。里特不得不离开剑士之岛，成为“猎人”不断地磨练自己的剑技。这已是3年前的事情了。
被兄长背叛后的里特，因为害怕相信别人所以不肯敞开自己的心扉。艾蕾娜听完后，为里特感到难过，斯盖便说只要她有这颗关怀、信任里特的心就足够了。次日，梅尔菲斯依然没有出现，里特便提议到供奉御神体的古雷鲁山去看看。众人刚出村不久，格达追了上来，将钉在里特家门前的纸条交给他，上面是梅尔菲斯的留言，要里特到回忆的台地等他。里特一行往古雷鲁山顶走去，一路上只见满目苍夷，这全系梅尔菲斯所为。抵达山顶的祭坛处，里特带众人入内观看，原来所谓的御神体乃是被封印的“巴鲁玛之角”！出了祭坛，便看到梅尔菲斯站在山坡上，说他们以前所追寻的“理想剑士”不就是强大的力量吗？而力量则能决定正义。里特反驳真正正义是在心中，梅尔菲斯是败给了自己的欲望。梅尔菲斯见双方已无话可谈，便先行一步到回忆的台地与里特他们决一死战。梅尔菲斯分三个部分：本体、魔剑、增殖部分。魔剑只有魔法才能对其造成伤害，而增殖部分则是必杀技特别有效。一场激战后，里特终于击败了梅尔菲斯并令其恢复了神智。梅尔菲斯用剑支撑着身体告诉里特，当初因为莉娜被巴鲁玛之角附身，所以自己不得不杀了她，而且正如里特所说，自己败给了内心深处的欲望而被巴鲁玛之角附身，已经忘却了究竟是为了什么而想要强大，等发觉时业已失去了太多东西……说着，梅尔菲斯不支倒地，里特忙上前扶起他。梅尔菲斯微笑道：“最后能见到你太好了。”他一直希望的其实是由里特的手让自己从诅咒中解救出来，咽气之前梅尔菲斯告诉里特，神剑在古拉纳悬崖的东面。眼看着梅尔菲斯就此死去，里特在悲痛中被巴鲁玛之角附身，还想挥剑砍艾蕾娜，但在众人的呼喊中最后及时收剑，并昏倒在地……
众人带着昏迷不醒的里特回到村子里，村民们知晓一切后都深感后悔，他们一直都只将过错推在梅尔菲斯兄弟俩身上，而逃避自身的责任，忘却当初磨练自己的真意。逖奥询问马雷古，是否要处分被角附身的里特，得到的回答却是希望里特能活下去。逖奥对此大感不解，为何马雷古想要杀死梅尔菲斯，但却不愿对里特下手。马雷古抚摩着她的头，慈祥地说支持人类生存下去的还有信赖、爱、尊敬等这些东西，每个人都有自己最重要的东西要保护。在宿屋的寝室内，无论艾蕾娜怎样呼唤里特，都不能令他清醒过来。艾蕾娜只得呼唤出米蕾妮娅，恳求她帮助里特。但米蕾妮娅却说如果她吃掉巴鲁玛之角的话，会连同里特的心一起抹杀掉。接着米蕾妮娅强制占据艾蕾娜的身体，并打算吸收巴鲁玛之角，不过她的动作却在中途停了下来。已经对里特滋生出深厚感情的她，根本下不了手。米蕾妮娅呼唤出艾蕾娜的精神体，要她前往里特的内心世界唤醒他，而自己则在此压制住巴鲁玛之角的力量。 无垠的黑暗中，里特的心在过去的回廊中徘徊着。与好友格达一同练剑的情景，与兄长梅尔菲斯发誓的情景，与莉娜他们快乐相处的情景，然后是那个暴风雨之夜……“为了贯彻自己的正义而追求力量”“如果想获得打倒非人存在的强大力量，那么自己也必须抛弃人的身份”梅尔菲斯对他道。被魔剑钉在大地上的莉娜，含笑说如果梅尔菲斯成为了超越人的存在，那么自己牺牲也没关系。“不对！”艾蕾娜突然出现在里特的内心世界，“将痛楚的感受铭刻在心中，以人类的姿态生存下去、战斗下去！为了守护无可替代的东西。”“力量并非一切，剑是在自己的心中，为了真正的正义。”艾蕾娜的呼唤，米蕾妮娅的努力，终于令里特苏醒过来，巴鲁玛之角被封印在他的体内。与村人们告别后，里特他们再度踏上寻找神剑的旅途。
根据梅尔菲斯的遗言，里特一行离开剑士之岛，前往亚拉古纳大裂岛，据说神剑就在该岛中央的紫云之塔。一路平安无事，顺利抵达亚拉古纳大裂岛后，下船进入高斯森林中，但见森林中到处是巨大的植物，有时必须躲开巨花喷射的毒雾，有时则要利用植物的茎干前行。此时马雷古提议先到北边的纳纳恩村休息一下，那里乃是他的故乡。当众人走近纳纳恩村时，看到附近一大片土地都枯竭了，马雷古告诉大家此乃梅尔菲斯所为，他在此地解开了巴鲁玛之爪的封印。
进入纳纳恩村内，众人受到村民的热烈欢迎。马雷古向长老说明梅尔菲斯事件之后，长老告诉大家，纳纳恩之民既不属于光也不属于暗，对于他们来说暗未必都是邪恶的。光与暗就如同火与风，火能令人温暖但同时会烧尽一切；风是寒冷的可却能运送种子。里特听后略有所思，但是身为光之神古拉纳斯神官的艾蕾娜则坚决反对这一说法。接着长老问里特，为何要取神剑，里特回答为了不再逃避，并非是因为考虑到光、暗之神。长老听了很欣慰，说只要从心里对于大自然的恩惠而感到喜悦、坚强地生存下去就可以了。
为了欢迎村内最强战士马雷古的归来，村民们决定举行祭典，但是缺乏一种必要材料，于是就拜托里特与艾蕾娜一同去禁断之室。两人欣然应允，走入禁断之室后发现里面空无一物，正在纳闷间，旁边的村民启动机关，地上出现一大窟窿，里特与艾蕾娜立刻掉入其中。好在洞窟下有厚实的稻草铺着，虽然没有摔伤却跌得屁股痛。两人一阵埋怨后继续前行，在宽阔的洞窟中央发现一块石碑，上书“祈求大地恩惠者唷，往右边的试练场。”石碑上蹲着一只巨大的卡罗，它带两人进入试练场。此乃一个MINI GAME，通过方向键移动里特，然后按A键拾取果实，但要注意不能碰到红色的果实，否则会麻痹。每次皆会给玩者一个规定的果实数，只要拾到其规定的数目就能换取奖品。建议大家在离村之前多玩两次这个游戏，便可获得一个增加金钱的道具和一本“武者之书”。取得果实后，里特与艾蕾娜走向出口，穿过满是青汁的池塘，通过弹簧座回到地面上。结果村人要里特他们去取的倒不是果实，而是那气味独特的青汁。入夜，村民们载歌载舞祝贺丰收，艾蕾娜亦忍不住唱起了光之歌。一旁的马雷古与逖奥谈心，逖奥对于自己是否能拥有人心而迷惑，马雷古让她不要称自己为主人而直呼名字。逖奥犹豫着说出“马雷古”时，觉得有种温暖的感觉，马雷古笑着告诉她这就是她拥有心的最好证明。里特与艾蕾娜来到泉水边，里特向艾蕾娜致谢，自己被角附身时多亏有她相助，并表白自己觉得艾蕾娜已是心中最重要的人。面对里特的告白，艾蕾娜却无法回应，她害羞地借口去泉边喝水而跑开来了。来到泉水边，艾蕾娜为此事苦恼，米蕾妮娅出现在水中责备艾蕾娜不应听从塞拉的话，并说若是自己，只要为了里特可以献出自己的身体与性命。里特在泉水附近徘徊着等候艾蕾娜的归来，却见回来的乃是米蕾妮娅。米蕾妮娅问里特究竟在两人之间选择谁？里特无法回答她，只觉得米蕾妮娅一会儿出现一会儿消失，给他不安定的感觉。米蕾妮娅说自己已没有时间等待里特的决定，扑到里特怀里强行索吻。当里特与米蕾妮娅接吻时，她却又突然变回艾蕾娜。艾蕾娜误以为里特最终选择了米蕾妮娅，伤心地跑开了。
次日，众人各怀着心事离开纳纳恩村，前往大地裂缝中的紫云之塔。穿过高斯森林的东部，不一会儿就来到了大地裂缝。一路往下爬，终于看到了被厚实的等离子云壁包围着、宛若龙卷般的东西。在云壁外的黄沙上散落着诸多人偶的碎片，逖奥说那些都是神魔大战时巴鲁玛制造的士兵，而这附近应该有控制龙卷风暴的制御室。众人往前行没多少路，就找到了恶魔之暗（DEMONS LOW）。开启两边房间里的装置，打开居中的大门，往深处走便是制御室。在制御室内居然还残留着一具指挥官人偶，她命令逖奥去破坏插在巴鲁玛身体上的神剑，遭到拒绝后就释放强力的电流企图消除逖奥的记忆，好在逖奥奋力抵抗，并表示自己已找到了心与她们不一样，不再是受人摆布的人偶了。众人上前帮助逖奥击倒那指挥官后，解除龙卷风制御装置，并回到云壁处。此时云雾业已散开，只见一柄巨大的紫色宝剑直插入地，将巴鲁玛的身体牢牢地钉在地上，大地从其下裂开，裂缝一直延续向远方，形成了分割世界的大峡谷。众人正待前往神剑处，突然从旁边的山崖上传来一阵高笑，抬头望去，竟然是茜蕾妮与圣堂骑士！茜蕾妮夸奖艾蕾娜办事得力，然后她割伤自己的手，令血滴在神剑下的巴鲁玛身体上，身体立刻膨胀起来，紧接着茜蕾妮将圣堂骑士推下去作为巴鲁玛身体的祭品令其复活！里特他们大为不解，但此时的情景不容得去理会茜蕾妮，艾蕾娜变为米蕾妮娅催促众人进入身体内打倒其控制中枢。
里特他们跟着米蕾妮娅进入巴鲁玛身体内，先通过触手通路进入静脉，这里需要不断地通过升降梯、切换按钮来前行。然后至球体空间令血管颠倒，再由动脉回触手通路，来到中枢内。击倒与巴鲁玛身体同化的圣堂骑士后，米蕾妮娅正待吸收巴鲁玛的身体，里特上前阻止，米蕾妮娅反驳说她只是想要回自己的身体，这又有什么错？说完，她气呼呼地变回艾蕾娜。巴鲁玛的身体崩溃后，神剑亦随之倒在地上，大家正为如何将此庞然大物带回去而发愁，逖奥却说她可以制御神剑。说着，带众人进入神剑内部的控制室，令神剑飞了起来！
在飞往桑托海姆法国的途中，艾蕾娜闷闷不乐地表示很累了，要到房间里休息一会儿。进入房间内，米蕾妮娅出现在镜子里，责备艾蕾娜不应该顺从塞拉的意思，应该多考虑一下里特。艾蕾娜立刻与米蕾妮娅吵了起来，说自己最讨厌她并要米蕾妮娅消失！就在这时，天空突然暗了下来，血红的巴鲁玛之月上似乎有什么东西在蠕动着，显得异常诡异。艾蕾娜惊呼此乃“暗之日”、是巴鲁玛复活的征兆，但她又不相信暗之日竟会来临，因为自己一直在努力令巴鲁玛无法复活。神剑加速飞行，很快就在桑托海姆法国的牧场停了下来。出得神剑，却听到村人的呼救，并得知当暗之日出现后，大家跑到神殿前询问，此时圣堂骑士竟突然斩杀村人！里特他们急忙进入市内，正撞见圣堂骑士在行凶，将其打倒后发现这些骑士都是被制造出来的人偶！赶到神殿前，茜蕾妮拦在门口，狡辩说命令圣堂骑士杀人是让人们从其罪恶中解脱，死是唯一的方法，这亦是她的使命。说完，茜蕾妮从高台上跳下，与诸多圣堂骑士合体成为巴鲁玛的心脏，向众人发起了攻击。击倒心脏后，艾蕾娜直接吸收了它，并不理会里特的质疑，径自往神殿内走去。里特他们紧随其后来到大圣堂的神圣之扉，见到艾蕾娜正在质问塞拉，为何会出现暗之日？为何茜蕾妮乃是巴鲁玛的心脏？接着，里特他们得知塞拉所说的封印巴鲁玛方法，竟然是让艾蕾娜收集所有的巴鲁玛碎片后，再让神剑贯穿她的身体，同时杀死巴鲁玛！艾蕾娜急着让塞拉赶快举行仪式，不要让巴鲁玛复活。于是塞拉将众人带到禁断之间，给他们看记载着过去神魔大战的壁画、世界的真实！
在很久以前，光与暗对立的存在，双方经常交战着，引起人们之间的争执，最终爆发了神魔之战。诸多神剑如火箭般射向空中，巴鲁玛吸收着人的恐惧不断地扩大，激烈的战斗进入尾声，光辉四射的古拉纳斯与紫黑色的巴鲁玛相互撞击，最后——光完全被暗所掩盖、打碎、消失……
众人看着眼前那难以置信的画面，塞拉说出令艾蕾娜更受打击的话语：“事实的真相是，我们一直信奉的光之神古拉纳斯在神魔大战时已经死了！所以现在的世界因为失去了神而歪斜，未来成为黑暗的所属品已成定局！失去光的引导，人们陷入痛苦中，其魂魄成为黑暗。如今古拉纳斯这种虚伪的教义已无法引导人们，不可能再支持人的心了。为了拯救世界，唯一的方法就是让巴鲁玛复活！”艾蕾娜听后瘫倒在地上，她万万没有想到自己的一起努力都是白费的。塞拉让艾蕾娜去寻找神剑的目的并非为了封印巴鲁玛，而是要解放巴鲁玛身体，让艾蕾娜取得所有的巴鲁玛碎片从而使之复活。接着，塞拉带着失魂落魄的艾蕾娜自魔法阵前往巴鲁玛之月，举行最后的复活仪式。
里特他们急忙赶回神剑内，乘着神剑以其最后的能量飞往血红的巴鲁玛之月。此时里特体内的巴鲁玛之角再度开始活发化，所幸里特拼命压制了下来。进入月亮上的巴鲁玛子宫内，不断利用骨头等机关的移动，抵达最深的部位，塞拉和艾蕾娜正在那中心装置里。
塞拉指出艾蕾娜的慈爱只会令人受伤，增加不幸。艾蕾娜为了防止暗之日、消灭巴鲁玛，而欺骗了里特，但自己的所作所为却相反地帮助了巴鲁玛的复活。她不由得想向古拉纳斯祈祷，塞拉打断艾蕾娜的祷告，说向已经死去的神祈祷有什么用？塞拉的话令艾蕾娜更加自责、绝望，丧失了生存的意义。塞拉便要艾蕾娜将她痛苦的根源——巴鲁玛之翼从心中削除。
里特拼命地拍打着防护罩，想引起艾蕾娜的注意，却招来了卵的防卫者。激战之后，却见艾蕾娜业已听从塞拉的话，躺到了装置内，其心的黑暗部分——米蕾妮娅从她的心中强行分离出来。米蕾妮娅出现后嘲笑艾蕾娜根本不明白真正重要的事情，但她却因为喜欢里特所以无法成为完全的巴鲁玛。不过若是成为毁灭世界的魔神后，或许会连里特也杀掉的，米蕾妮娅并不想成为这种怪物，只想与里特在一起！因为米蕾妮娅拒绝成为完全体的巴鲁玛，塞拉便抛弃自己的身体与巴鲁玛融合，并吸收了米蕾妮娅。欲以自己的意志创立新世界，成为完全唯一存在的神！在最后关头，米蕾妮娅用尽自己最后的力量，将艾蕾娜释放出来，然后笑着对里特说：“能够与你相遇真是非常高兴，能够喜欢上你太好了。由我来守护你，所以请生存下去，请不要忘记我……”
眼看着米蕾妮娅被吸收，里特却毫无办法，马雷古见情势危急，便与逖奥拖着里特和艾蕾娜逃出子宫，回到神剑处。可是途中却遭到无数怪物的拦截，逖奥还说明神剑的能源不足，可能无法启动，里特亦不愿丢下米蕾妮娅不管而逃走。马雷古告诉里特，一定要消灭巴鲁玛，现在找不到打倒他的方法就先活下去，一定有他必须要做的事情，生存下去才能找到胜利的方法！这是舍弃自己的命而不得不做的事情，如果是男人就要有这种觉悟！语毕，马雷古让逖奥带着里特他们先行离开，自己则留下来断后。神剑的窿窿启动中，逖奥和里特他们的哭喊中，马雷古被无数扑上来的魔物所埋没……
神剑终于离开了巴鲁玛之月，用尽所有的能源，坠落在萨拉姆王国南方的平原上。艾蕾娜为自己的行为感到懊悔，自己欺骗了里特、削除了米蕾妮娅、并让巴鲁玛复活，然而米蕾妮娅却救了自己，现在的艾蕾娜业已失去了生存的意志，只想寻求死亡。逖奥亦道以前自己不知道心是什么，后来马雷古教会了她各种感情，但是如今这种悲伤，却令她觉得还是不要知晓心的比较好。此时里特走了过来，虽然米蕾妮娅与马雷古的牺牲给予他很大的打击，但他却是三人中恢复得最快的。他告诉逖奥与艾蕾娜：“马雷古与米蕾妮娅都说要生存下去，究竟该怎样我也不知道。但是，我们不能因此什么也不做，正如马雷古所说，我们有必须要做的事情，男人有赌上姓名也必须要做的事情，这是一定存在的。”三人打起精神，此时却见跟随着神剑一同来到地上的诸多魔物飞往前方的萨拉姆王国！
里特他们急忙赶到萨拉姆王国，清除了街道上的怪物后，来到王宫找罗安商量，罗安让他们先休息一下。艾蕾娜依然继续自责着，她所信仰的神早已死去，而巴鲁玛又复活了，世界濒临终结，自己的愿望、信赖全部崩溃了，不知道应该做什么。里特走过来安慰她：“你并没有错，一切错在塞拉。你并不是古拉纳斯的召唤使，与暗之民接触后就该明白这一点。你所要守护的并非光之神的教徒，而是要守护人们，你与我们大家都是一样的人。”艾蕾娜听后不禁自问：“我要守护谁？我所喜欢的是……真正爱的人……”
另一边厢，在执务室里，罗安听了执政官的报告后，对于他所提出的方法表示质疑，并说不能将此事告诉里特。待执政官退下后，罗安对一旁的逖奥说感到她与先前的样子不同了。逖奥回答道这是因为自己获得了心，但相对地失去了最重要的东西，这就是获得心的代价吗？成为人的证明吗？看到逖奥痛苦的样子，罗安说他以前也曾经历过，所以很清楚当自己所爱的人死去时那份难过。当初罗安在母亲去世时，亦觉得此世界好象终结了一般。但是正因为这份痛苦令自己明白真正重要的东西，希望能守护并为此而战斗。此时，里特与艾蕾娜走进来，罗安劝里特逃跑，以免让塞拉成为完全体的巴鲁玛。但是里特不愿意就此逃避，他决定寻找打败巴鲁玛的方法，战斗下去。艾蕾娜却道：“现在什么希望也没有，难道死就是勇气吗？我不想失去你，不想失去任何人，更不想失去你的温柔。”里特坚持现在唯有自己体内的巴鲁玛之角可以与塞拉对抗，逖奥则提醒他如果用角的力量就会与梅尔菲斯一样的下场。艾蕾娜不断地劝戒里特：“马雷古与米蕾妮娅守护的不是武器，而是你的命，为何要做这种无谋的事情。”罗安亦道：“以恶魔之身而生存毫无意义，只追求力量正中了巴鲁玛的下怀。而且我们也不知道解放角的方法，还是先离开此地吧！”
罗安将事务移交后，与里特他们一起正打算离开萨拉姆城时，突然里特手腕中的角一阵剧痛，巴鲁玛之月上睁开了一只巨大的眼睛，俯视着此星球。对方似乎察觉到失去的角就在里特身上，紧接着先前被里特打倒的怪物复活过来，站在一旁的母亲为了保护女儿而被击倒在地。这正应了古拉纳斯教典中的话“死者苏醒，制裁生者”。再度将怪物杀死后，那位母亲的尸体竟然也变成了怪物！里特不得不在女孩面前挥剑斩杀了她，这令里特更加无法容忍巴鲁玛的所作所为，结果自己还是做了与哥哥相同的事情。罗安他们赶忙劝解里特，愤怒只会夺走他的心，就象梅尔菲斯那样，心继续陷入无尽的痛苦中，最后就会堕落成为巴鲁玛。里特终于冷静下来，罗安提议到附近的王家之墓去看看，那里保留着过去“暗之民”的历史，或许可以从中找到消灭巴鲁玛的方法。
一旦有了目标就尽快行动，众人出了萨拉姆城，打算往神剑坠落的地方去。此时萨拉姆城的道具屋内可以购买到高级的装备，而且在王国附近的拉乌鲁丘陵会变成一个隐藏迷宫。此迷宫对游戏情节毫无影响，但因在丘陵最后方的废墟内有着诸多宝物及最强装备，所以建议大家带上十几个回复MP、SP的道具、装备增加行动力的防具，然后到废墟内寻宝。此时废墟里的怪物都是等级非常高的大恶魔，若是被它们抢先使用核爆魔法的话，没准会遭到队伍全灭的危机！所以对付这种敌人一定不能吝啬，抢先使用最大必杀技与无属性的核爆魔法，一举消灭它们！
完成拉乌鲁丘陵的寻宝活动后，便可以进入正题，到神剑坠落的地方——王家之墓。逖奥先启动里面壁画上的开关，然后走出墓室，进入下方的遗迹——诸神的生地。这里面有蓝色（地球）、红色（太阳）、黄色（月亮）三种门，在第一层的控制装置只能开启蓝色的门，然后至第二、三层开启红色的门（此时蓝色的门会关闭），并绕回来拾取一些宝物。最后开启下面黄色的门，再回到上两层拾取一些以前无法拿到的宝物。当电梯上蓝、红、黄三色全齐后，再把黄色的门关闭，乘上电梯便可至最下层的中枢控制室。在那里众人发现了旧文明时代的力量单元、古拉纳斯与巴鲁玛两个纹章重叠的装置。控制室内依然正常运行的管理者艾尔摩告诉里特他们，此地乃是过去研究古拉纳斯与巴鲁玛的场所，为了诞生那种力量而进行了各种实验。当艾蕾娜问及巴鲁玛封印一事时，艾尔摩却有点莫名其妙，她根本就不知道封印一事。被艾蕾娜他们称为封印的装置其实是为了收集四散的巴鲁玛之力，而其本来机能是令巴鲁玛活性化，并令巴鲁玛依附在人身上。古拉纳斯则是人类与巴鲁玛同调转变后的新姿态。艾尔摩看出艾蕾娜他们对于巴鲁玛的认识有一定的误解，便让众人看太古的记录——古拉纳斯给人的心以光明的能源力量，而巴鲁玛则给人的能源为暴走、破坏之力。巴鲁玛以人的意识为自己的核，封印则是令人能制御自己的心、控制巴鲁玛，这样就可以让心中的破坏转为光明，形成古拉纳斯。
知晓古拉纳斯与巴鲁玛关系的事实后，里特决定与自己体内的角进行同调转化，抱着想守护所爱之人的心情，一定不能输给巴鲁玛，一定要制御自己的心。众人眼见别无它法，只得同意里特去冒险。临别时里特与三位伙伴一一话别，“逖奥，我必须向你道歉，曾经以为你是个人偶。”“没关系，我相信你。我喜欢人类，想看见人类的未来，所以请让我见到此梦想。”“罗安，你带大家到远处去避难。”“里特，能够与你一起旅行对我来说是非常重要的，一定要胜利！”艾蕾娜忍不住跑到一边哭泣：“为什么会这样？我是想救大家而努力，可却不能在一起。我究竟做错了什么？”里特走近安慰她：“你没有错，我会赌命守护你的温柔，即使死了也要让你活下去。”“里特，我相信你，请分一点你的坚强给我。”两人相拥在一起，艾蕾娜含泪话别：“无论你变成什么样的姿态都没关系，只是请一定要回来！”
目送伙伴们离去后，里特站到封印装置中，进入自己内心的深层世界，斯盖亦及时跟了过来。在无尽的黑暗中，听到变成巴鲁玛的塞拉在说：“世界已步向灭亡，失去了神的祝福。灭亡的命运已成为定局，这个世界不会有未来。你所希望的神之奇迹，想成为拯救世界的神吗？”此时选择第二项“不是这样”。里特反驳道：“我不会输给你，我不想成为神！假冒神的你根本没有拯救世界的资格！”塞拉：“你想要神的力量吗？你所相信的争议是绝对的吗？想要强大吗？令世事都如你所愿。”依然选择第二项，“正义不是光凭力量就能行得通的，相信爱才是我强大之处。”塞拉：“你的爱是什么？帮助别人而索取报酬，只不过为了自己的心获得安慰而已。只要把大家的心当做自己的东西就行了。”里特：“不是为了自己，人的愿望不能被欲望所掩盖。你才是真正邪恶的东西！”塞拉：“力量是什么？”里特：“我所寻求的不是力量，而是想守护的人！”对话结束后，里特脚底的土地突然崩裂，整个人坠入熔岩中……
现实世界中，巴鲁玛之月坠落下来，覆盖了整个萨拉姆王城，化为新生的巴鲁玛，王国成为一片火海。在南方平原上避难的人们都非常恐惧，艾蕾娜想起自己的职责、自己所能做的事情——就是唱歌给予人心以希望和勇气。在艾蕾娜那温暖人心的歌声下，人们的恐惧渐渐平息下来，大家齐声高歌给自己鼓劲。
无尽的黑暗中，里特感觉自己已变成丑陋的巴鲁玛，此时艾蕾娜的歌声传来，再加上斯盖的鼓励，令他的心一阵温暖，整个人被光芒所笼罩……艾蕾娜身后突然出现一道光柱，里特平安无事地出现在光柱内，手中紧握着古拉纳斯的神剑“光之佩剑”。他挥剑劈开乌云，向新生巴鲁玛挑战，并带着三位伙伴飞入其庞大的身体，进行最后的决战！
作为最后的迷宫，稍微花费一点时间，路途也比较繁杂，有很多分叉和机关。这里有种敌人行动力很高，经常吸取味方HP，所以最好让每个角色装备回复HP的武器防具，并配备多次攻击的护符。在一血管的地方会有光球移动，只要碰上光球就会遭到敌人的袭击，最好的方法就是等光球经过后跟在它后面走，即可平安通过。还有就是先前如果没有替米蕾妮娅的必杀技提升到顶的话，建议这里要保留一些SP POINT不要用掉。
最后来到巴鲁玛的核心处，先与塞拉交手，此时应装备防石化等异常状态的护符。然后塞拉竟然派出巴鲁玛之翼——也就是米蕾妮娅与众人交手。不过此时的艾蕾娜不再迷惑，她认定此米蕾妮娅是假的。一番激战后，假米蕾妮娅立刻消失。艾蕾娜表示自己已不再害怕，因为米蕾妮娅就是自己。说完，米蕾妮娅立刻从艾蕾娜身上分离出来，依然口不饶人地责备艾蕾娜领悟得太晚了，害她等待了不少时间。众人抱着只要心灵坚强就不会落败，气急败坏的塞拉将核分离开来，逖奥与罗安留在了巴鲁玛身体内，里特、艾蕾娜与米蕾妮娅则前往塞拉所处的混沌之间。建议将米蕾妮娅的必杀技“咒缚之瞳”、“堕天之翼”、“诅咒之爪”，里特与艾蕾娜的最大必杀技提升至顶级，每人（特别是里特）装备减少SP、MP消耗的护符，配备有核爆、陨石大魔法的魔法书（回复魔法基本上是不需要的）。在混沌之间会依次与巴鲁玛之舌、目、爪、心脏以及塞拉对决，其实每次BOSS战后可以回去回复HP、MP、SP的，而且如果米蕾妮娅的“咒缚之瞳”升到MASTER的话，其成功率为100%！基本上舌、目、爪、心脏只要缚一次就能令对方毫无还手之力直至被扁死，而最终BOSS塞拉最多缚两次即可解决，非常轻松地便可赢得胜利（难度太低，没有成就感啊……）！
巴鲁玛终于被消灭了，里特他们发着耀眼的光芒，如同古拉纳斯般徐徐降落地球……深不见底的古拉纳大裂缝泛出光芒，注满了水流，成为大陆交易的动脉……一年后，罗安再度便装出游，寻访过去一同并肩战斗的伙伴：逖奥在萨拉姆城当护士，照料在战争中受伤的人们；米蕾妮娅在交易都市利里格的学校当老师，斯盖亦在她身边帮忙；在马雷古的故乡，罗安将逖奥给他的项链放在了马雷古的墓前；艾蕾娜则成为名副其实的歌姬四处巡游，如今在米路姆村停留；爱拉已清醒过来，与母亲桑德拉幸福地生活着……但是没有人知晓里特的下落，不过艾蕾娜与米蕾妮娅一点都不担心，她们相信里特最终还是会回到她们身边的……某山顶上，里特将光之佩剑埋在土中，眺望着远方……