Chapter 01 Trial Run - Syndicate Warehouse
【故事简介】
　　当女主角Konoko在TCTF（Technology Crimes Task Force）总部完成了训练，Griffin就要她到被Syndicate占领的货仓内，找回他们的密探Chung，因为Chung的PDA上有Syndicate的重要资料，所以Konoko就只身走到了那间货仓。
【过关攻略】
　　起始会在一平台上，下去消灭下方一个敌人，再启动有红白凌形标记的终端机，把门打开继续前进。通过门到隔壁走到二楼房间，启动有黄白凌形标记的终端机把门打开，通过门到隔壁走回一楼左面第一个房间，启动有绿白凌形标记的终端机把门打开，先走回二楼通过门到隔壁遇见已死去的Chung捡起他身旁的PDA后继续前进。走进前方的房间通过上楼梯再向前进，沿路通过S弯直走至未端下楼梯，至房间启动有蓝红圆形标记的终端机把门打开，通过门到隔壁走到三楼房间，启动有红白凌形标记的终端机把门打开，回到楼下二楼通过二道门和一白衣服的NPC谈话，再到三楼去再和另一白衣服的NPC谈话，通过他打开的门到隔壁并且下去一楼到货仓中央，通过上方有绿灯的闸门至隔壁，并于三分钟内抵达右方三楼处启动机器，便可阻止货车逃走并且通关。
Chapter 02 Engines of Evil - Manufacturing Plant
【故事简介】
　　当Konoko完成了第一项在货仓的任务之后，她就按照Chung在PDA的资料，去到了一间研究和开发新型机器的工厂，但当Konoko到达时，Syndicate已经占领了那间工厂，现在Konoko设法去化解这场危机。
【过关攻略】
　　在大厅先向右方前进，在门后玻璃房内启动一有白色反Ｆ状标记的终端机，把门打开继续前进。通过三扇门到一走廊上，再向左通过一扇门走进房间内，启动房间中央有红色反Ｆ状标记的终端机，把门打开继续前进。通过二扇门抵达玻璃房内和一女的NPC谈话，并启动一有绿色反Ｆ状标记的终端机把门打开继续前进。原来是回到大厅，此时向右方楼梯向上前进，走到吊梯末端通过有红色反Ｆ状标记的门，再通过一扇门下楼梯走入机房，在机房再向左走至未端，通过红色机器旁的门上楼梯，通过一扇门至一房间，先不要下楼梯，沿路前进再通过一扇门抵达一条有红外线防守的走廊，通过走廊至末端的门，至房间内楼梯下方启动一有枪型标记的终端机，把红外线系统关闭。回到有红外线防守的走廊，走进隔壁房间启动房间中央有咖啡色反Ｆ状标记的终端机，把门打开继续前进。再回到有红外线防守的走廊，走回去最早可下楼的房间，通过下方有咖啡色反Ｆ状标记的门，和一NPC谈话并启动房间有蓝色反Ｆ状标记的终端机，把门打开继续前进，又回到有红外线防守的走廊，走进隔壁房间有蓝色反Ｆ状标记的门内，启动房间有黄色反Ｆ状标记的终端机把门打开继续前进，回到红外线防守的走廊未端的房间走进有黄色反Ｆ状标记的门，下楼梯至另一房间内把房间中的人造脑关闭，方法是绕著人造脑外围跑并启动其东、南、西、北四个方向的开关，重复此方法三次便可把人造脑关闭，并且通关。
Chapter 03 Puzzle Pieces - Bio-Research Lab
【故事简介】
　　Konoko在工厂和Syndicate的人战斗时，另一票Syndicate正在攻击市中一所生化研究中心，所以Konoko就前往生化研究中心，但当她到达时，Syndicate的改造人Barabas已经在门口等，这一回Konoko又如何应付呢？
【过关攻略】
　　先在广场与一BOSS级的敌人对战，赶走他后向右进入大楼，就在门口旁的中央有一个小房间，走进房间启动有橙色、白色三角状标记的终端机把门打开继续前进。走回大厅至左方、右方的实验室消灭敌人，再向上移动把二楼的敌人消灭，并启动小房间灰色、白色三角状标记的终端机把门打开继续前进。走回大厅至左方、右方的实验室消灭敌人，再向上移动把三楼的敌人消灭，并启动小房间蓝色、白色三角状标记的终端机把门打开继续前进。走回大厅至左方、右方的实验室消灭敌人，再向上移动把顶楼的敌人消灭，走到顶楼的一端进入另一道门，沿楼梯继续向上，到另一房间走出另一道门，把外面敌人打倒再回到房间内搭升降机至另一大厅，至升降机对面后方启动中央有橙色、白色四方状标记的终端机，利用未端楼梯上楼，进入楼梯旁的房间启动中央有橙色、白色四方状标记的终端机，再向三楼移动，至三楼对面另一端后方启动中央有橙色、白色四方状标记的终端机，此时回到另一方向有一房间被打开，进入那扇有橙色、白色四方状标记的门后，再通过一扇门抵达化学反应器，走到最底层启动楼梯下方的白色四方条状标记的终端机，把对面的闸门打开接著利用三级跳，通过化学反应池中的石柱至对岸，通过闸门并走出门外便可通关。
Chapter 04 Tiger by the Tail - Airport Assault
【故事简介】
　　Syndicate要把偷取的东西运走，所以他们已经有人在攻击机场，Konoko到达机场时，见到了他们的首领Muto，但由于机场已经被Syndicate占领，所以Konoko要完成这次任务是十分艰难。
【过关攻略】
　　走进机场大厦，向右走到未端再向左走，启动大厅中央有白色飞机状标记的终端机，把门打开继续前进。沿路向前通过两扇坡璃门走到一行李处理区，向下走消灭下方敌人，再利用右方出口走出停机坪，走至停机坪右方另一端，利用另一行李处理区回到机场大厦，沿路向前通过两扇坡璃门走到未端，大BOSS就在此消灭他两名手下后，进入他俩刚出来的房间，启动房间黄色、红色棱形状标记的终端机，把门打开继续前进。进入飞机修理坪先到对面二楼的控制台，启动红色锁匙状标记的终端机把门打开，再回到刚刚出来的二楼的控制台启动红色、黄色圆形状标记的终端机把闸门打开，下去走到闸门，通过闸门并走出门外便可通关。
Chapter 05 Hot Pursuit - Airport Cargo Hangars
【故事简介】
　　为了追Muto，Konoko打开了往飞机库的路，当她到了飞机库时Muto正想要飞走，阻止敌人的飞机起飞Konoko方可完成任务。
【过关攻略】
　　进入货柜区的房子后向左前进，沿走廊外出是一广场，走廊未端有一道黄色、黑色立体四方型标记的门，就在走廊外右方的二楼(最接近走廊的二楼区域)，启动黄色、黑色立体四方型标记的终端机把闸门打开，下去走到闸门并走出门外至一房间，走到房间未端启动一斑马型标记的端机把闸门打开，回到外出广场走出中央斑马型标记的闸门，下坡走入货柜区，走至末端的房间启动房间内黑色、白色六角状标记的终端机，把门打开继续前进。走回货柜区走进黑色、白色六角状标记的门，门外是另一货物装运区，先至左方房间启动一斑马型标记的端机把闸门打开，接著向上移动，把上方吊在半空的三个控制室内的黄色、黑色立体四方型标记的终端机启动，左方也因此有门被打开，走出这扇黄色、黑色立体四方型标记的门外是顶楼，向右一直走吧！走了很久可看见有一条向上的楼梯，而它的门是锁上的，开关就在右下方被铁丝网围起来的地方。打开了黄色、黑色立体四方型标记的终端机把闸门打开后，沿路进入这道闸门，通过闸门向下一层一层移动，这里要和NPC交谈、在箱子上取得一件物品RAPPELLING HARNESS、走到底层通到门外就又要开始向上走了，走到顶层玩家可看见一个中空的厂仓，下方有一台运输机，此时，玩家必需走到运输机的上方的铁架上，站在地上闪黄光处便可通关。
Chapter 06ounterattack - TCTF Headquarters
【故事简介】
　　由于Muto知道的所有行动都被TCTF监视，所以Muto们便向TCTF的总部展开攻击，所以Konoko回到总部支援，但Muto的目标原来是另有其人。
【过关攻略】
　　一开始就来到TCTF的停车场向前走到未端，利用中央的门进入，再通过一门向右前进，通过装甲车场进入另一个区域，右方有一扇橙色黑色标记的门，其控制终端机在最左方的房间内(门外有橙色D型标记)，把闸门打开后进入该区，沿楼梯向上至二楼、三楼，清除所有敌人，然后走三楼到与刚刚一楼有终端机的同一位置房间去(门外有橙色D型标记)，先至房间启动蓝色标记的端机把闸门打开，然后自然是继续向上移动，进入蓝色标记的房间会抵达另一栋楼层，继续走到最顶层，未瑞有人会给玩家一个工具，取得后到升降机处，站在地上闪黄光处便可(升降机顶)，抵达另一楼层继续向上吧！这楼层中央仪表板前有红色、黄色四方形标记的终端机，把门打开继续前进。从打开的那扇门向上走，每上一层便要走到对角方向的房间，有楼梯继续前进，重复动作直到抵达顶楼，走向玻璃门外其中一个大BOSS又来了，消灭他便可通关。
Chapter 07 A friend in need - Atmospheric Conversion Center
【故事简介】
　　Shinatama被Syndicate捉走了，所以Konoko决定一个人前去救援她的朋友。
【过关攻略】
　　而开始来到一个广场前，向前角向右通过吊桥沿路移动，进入左方的控制室，并启动蓝色棱形标记的终端机把闸门打开。进入闸门通过控制室再进入另一道闸门，出来后再沿路一直走又再进入闸门，通过控制室再进入另一道闸门，此时靠右方前进，走道末端有另一间控制室，进去启动黄色向下图形标记的终端机，然后走到未端的平台去，搭乘升降机下降。离开升降机向左移动沿路前进，此时要走到未端再绕到另一面一间控制室那里，进去启动绿色棱形标记的终端机，然后走回未端那扇门去，进入闸门通过控制室再进入另一道闸门，从楼梯走至吊桥的上方沿路前进，抵末端去启动白色棱形标记的终端机，然后下去进入闸门通过控制室，离开控制室前进至末端，再向左转(U型)沿路前进，走道末端有另一间控制室，进去启动黄色向下图形标记的终端机，然后走到未端的平台去，搭乘升降机下降。离开升降机向左移动沿路，进入另一间控制室进去启动红色棱形标记的终端机，离开后走到未端向右转走入刚开启的那扇门内，里面是一个控制室，先把玻璃打破再启动有电形标记的终端机，然后走到窗台上跳上关闭电源的电柱走到对面(有限时哦！)，向左前进至未端，进入另一间控制室，进去启动啡色棱形标记的终端机，走入刚开启的那扇门内，里面又是一个控制室，重复刚刚的行为，先把玻璃打破再启动有电形标记的终端机，然后走到窗台上跳上关闭电源的电柱走到中间，然后跳到旁边的平台上，下楼梯走到底部，再启动有白色山形标记的终端机，然后走进已开启的门内，里面是发电机组(小心被电死)，沿路通过数道闸门至走道末端，消灭所有敌人便可通关。
Chapter 08 An Innocent Life - Atmospheric Conversion Center
【故事简介】
　　Konoko终于到了Shinatama的所在地，但当她见到Shinatama时，有一件出人意表的事情发生，当见到Shinatama时，Shinatama讲了一些有关Konoko的事给Konoko知，因此Griffin决定要把Shinatama毁灭。
【过关攻略】
　　由发电机组的右前方离开，走到外面是一个露台，从楼梯向下至底层，接著向前走通过一扇门抵达一广场，在前面的左角上找到Shinatama，但Griffin决定要把Shinatama毁灭，并开启了Shinatama的自爆装置，玩家要在30秒内离开走到在上面的房间，上楼梯向右面的门走进去便可通关。
Chapter 09 Truth And Consequences - Regional State Building
【故事简介】
　　在上次的事件Konoko成为了通缉犯，但Konoko依然想查清楚她的身世资料，所以她就前住Regional State Building，但有人比她先来一步。
【过关攻略】
　　走到上面原来是一间巨型的控制室，外面似乎是巨大的电场所在，先启动有电形标记的终端机，然后走到闸门至关闭电源的电柱走到对面，里面又是一个控制室，向左方红色的门移动。走向楼梯向上走两层，进入房间内启动有红色闪电形标记的终端机，然后走进已开启的门内，里面闪电大作，先把化学反应器关闭(共有三组系统绿、蓝、黄)，每关一组闪电会暂停玩家有十四秒时间走到下一组去，完成后从另一方的门离开。通过那扇门穿过房间，下楼去一直向下到底部，进入一红色门内抵达控制室，又要启动有电形标记的终端机，然后走到闸门至关闭电源的电柱走到对面，抵达控制室进入一红色门内，里面是一个中庭每层有一个研究室，向上移动至顶层之前一层，并且启动研究室内有白色棱形标记的终端机然后，再向上至顶层，通过一扇门后进入升降机内向上移动，抵达控制室启动有电形标记的终端机，然后走到闸门至关闭电源的电柱走到末端，此时敌人把风扇开启但主角己进入右方的房间了，此时便可通关。抵达一建筑物的大厅，从右方的门进入，穿过房间向左方门走到外面，在中庭的对面中央有一上锁的门，先到隔壁右方的房间启动有蓝色白色标记的终端机然后走到二楼的闸门里，在二楼右翼中间的房间内有另一蓝色白色标记的终端机，启动后可进入三楼的闸门，进入三楼的区域打开三个红色、白色标记的终端机(分别在左翼房间内、右翼房间内、中央)，接著到旁边走道利用楼梯至四楼的区域。进入四楼的区域通过刚刚开启的门到楼顶，接著走进隔壁的控制室启动有白色浅蓝色标记的终端机然后走回一楼，去中央一上锁的门那里。进入门后向下走进地窖里，闪被红外线所御系统进入左方的门内，门后是一条走廊走入走廊里的门后的房间，先走到地上闪黄光处，再启动后方的终端机，另一边走廊上的房间被打开，走到外面到那被开启的门去。进门去向上沿路走二层看到一条布满红外线的走道，通过它走到四楼，再沿路遇到另一条布满红外线的走道，走至未端的房间，看到一名黑色的机械人，紧追著它至未端便可通关。
Chapter 10 Cat and Mouse - Rooftops
【故事简介】
　　在Regional State Building见到了的黑色的机械人究竟是谁，他为何要拿Konoko的资料呢？为了找出这些秘密Konoko就展开了屋顶追逐战。
【过关攻略】
　　这一关中在屋顶上展开，先向左再沿路前进。玩家注意从屋顶跳到另一个屋顶的情况十分之多，而且有些屋顶距离都十分之远，所以善用跳跃(回转式跳跃)来帮助自己，否则掉在屋顶夹缝中就没解。另外当和最后的黑色的机械人对决时，他会使用Teleport来闪避玩家的攻击，他也会隐形和使出必杀技，注意他使用Teleport时会有时间差，利用这个机会攻击他。
Chapter 11 Dream Diver - Dr. Hasegawr’s Lab
【故事简介】
　　拿回了光碟的Konoko，回到自己父亲的研究室内，但当她看完有光碟之后，突然Muto在研究室出现，Muto为何会出现在这里呢？
【过关攻略】
　　一开始玩家来到一个烟雾幻的区域，首先就要对付Muto，上前把他打败之后，就会见到Shinatama跟随她，向楼梯走去，前面有一些细小的敌人，用脚扫攻击来攻击他们，接走上楼梯消灭里面有两个隐形的敌人，击倒他们之后，向左面的灰色门走去有路就走，向斜坡沿路走到另一个房间，反正如果见到Shinatama跟随她，有路就走。玩家要面对的是Konoko自己时就是到了本关的最后部份，因为她的攻击招式是和玩家的一样的，所以比较麻烦。注意，场中可找到一些物资，用来补充一下吧！
Chapter 12 Sins of the Father - TCTF Science Prison #112
【故事简介】
　　原来Konoko之前见到的所有东西都是一场梦，但Konoko想知道有关自己更多的东西，所以她就去TCTF（Technology Crimes Task Force）的保安中心，找科学家Kerr来问个究竟。
【过关攻略】
　　开始玩家就要面对一排红外线探测器(这里炮台是三炮把Konoko杀死) ，利用红外线探测器之间空隙通过，当过了红外线探测器之后便进入大楼中，从左或左方通道通过两扇门下一层楼梯进入一红色门后，启动有橙色标记的终端机然后走回上一层去，再从左或左方通道，通过两扇门下一层楼梯进入一蓝色门后，启动有蓝色标记的终端机然后走回上一层去，沿路通道再通过两扇门走到未端，先进去右方的房间与NPC聊一下，再启动有绿色标记的终端机，然后走到房外通过有一排红外线探测器的区域，进入另一个区域，这里有一条走廊，打开那有三个灯的闸门(橙色标记的终端机就在闸门的左右方)。通过闸门后便进入一段动画，结束后消灭一名敌人并启动有咖啡黑的标记的终端机然后从旁边离去，走进刚打开的门沿楼梯向上走，上去后启动有红色标记的终端机然后从该门离去，沿著斜坡走并且通过一排红外线探测器抵达另一个房间，走至房间未端下楼梯沿路再通过一道绿色巨闸，这里面是化学反应池，主角必需采用迂回方式通过左方及右方的控制室，并且启动控制室内三台终端机然后至未端利用吊机逃走，跳入水池中便可通关。
Chapter 13 Phoenix Rising - TCTF Headquarters
【故事简介】
　　Konoko知道自己的身世之谜后，她就决定回TCTF（Technology Crimes Task Force）的总部找Griffin给自己一个合理的答案，但当Griffin见到Konoko时，他竟然溜跑了，为了追Griffin所以Konoko又要深入TCTF（Technology Crimes Task Force）的总部内了。
【过关攻略】
　　到TCTF（Technology Crimes Task Force）的总部找Griffin但当见到Griffin时，他竟然逃走(电梯沈下去到底)。离开房间先去左方及右方房间内把红外线探测器关掉。先至中央房间内启动有红色字标记的终端机然后进入该门，从右方进入该门并且利用楼梯向下移。接著的部份就在第六关类似…，玩家只要反方向回到最底层(进入一红色门内)便会见到Griffin，他把Shinatama改造成类似第二关的怪物，同样的方法对付她，就是绕著Shinatama脑外围跑并启动其东、南、西、北四个方向的开关，重复此方法三次便可把Shinatama脑关闭(小必掉到下方也是没解)，而最后玩家可决定是否消灭Griffin，这将引起两个不同的结局事件。
1.如果没有杀Griffin的情形
Griffin就会在Konoko和Muto作最后对决时出现，而Muto是没有甚么特别的改变，只是会有两个敌人同时在后面帮他。
2.杀死了Griffin的情况
如果杀了Griffin的话，和Muto作最后对决时，Muto就会变成怪物(像吸血鬼)，当Muto身体在发光时，Muto是刀枪不入的，而且他的力量十分强(玩家在他没有发光时攻击他)。
Chapter 14 Dawn of the Chrysalis - Syndicate mountain Compound
【故事简介】
　　Konoko来到了Syndicate的基地内要和Muto来一个生死战，这也是她和大BOSS的最后一战。
【过关攻略】
　　到Syndicate的基地和Muto来一个了断，笔者在这关只作粗略介绍保留一些神秘感给玩家。Syndicate的基地分为四部份：
1.地面，基地入口在了望塔附近。侵入后进入。
2.地底前部在这里玩家只要把开关都开了，不久有一辆卡车回来，下去站在地上闪黄光处便可取得锁匙，再站在地上另一闪黄光处便可开启卡车冲进。
3.地底中部在这里玩家只要把所有房间的终端机启动，然后下方底部便有一堆人冲过来，利用这扇门去隔壁。
4.地底中部在这里玩家只要绕著楼梯走到最顶，然后启动最后的终端机，再站到中央的平台后，平台便会上升到地面，这时便可和大BOSS一决胜负了，打败他便可看到破关画面了。