《X档案》是一部在全球引起轰动的影视作品，其中的主要人物MULDER与SCULLY已成办许多影迷心中的偶像。现在，这部由影视片原人马制作的PC GAME终于和游戏玩家们见面了。在玩《X档案》游戏的过程中，大家会发现所谓分支只不过是因您所选择的选项不同而得到的不同回应，实际上完整的结局只有一个，所以相信您一定会找到真相的。
　　我，CRAIG WILLMORE，《X档案》游戏的主角，是一位隶属于西雅图（SEATTLE）联邦调查局的探员。我坚信，“THE TRUTH IS OUT THERE。”
SEATTLE FBL总部
　　SEATTLE今天忘了调闹钟，又迟到了。一进门，我的同事MARK便立刻迎面来取笑我。多选一：FUNNY（讲笑）；INDIFFERENT（不认同）；PARANOID（多疑）。随便选择其一，MARK笑完就会走开。我来到位于右方的休息室，从左上方墙上的柜子中取走所有的东西后，离开休息室回到我的办公室（走廊左面第一间房间）。一坐下电话就响了起来，是上司ARMISTEAD SHANKS要我到他的办公室去。到了走廊尽头的证物室左转便是他的办公室。进屋后与上司SHANKS及来自华盛顿总局的执行局长A D SKINNER谈话。原来是MULDER和SCULLY失踪了，我受命要把他们找回来。谈话结束后，我离开SHANKS的办公室。
　　从这以后，要将探案的每一步进展用PDA中的E-MAIL功能及时地向他们汇报，以听取他们的建议。
　　一出门，MARK便 即迎面上来问话。在三种态度里任选一个，和他一直说到没话可说，他就回头走了。
　　按照上司的吩咐，我回到办公室打开电脑，我的用名（USER NAME）是CRAIGWILLMORE，而密码（PASSWORD）是SHILOH。输完这些资料并确认连接，电脑 刻通知我有E-MAIL，读完E-MAIL后，利用PDA，按下SEND将MULDER和SCULLY的资料传送给其它分局。离开电脑，从桌上拾起一份案件档案。在读那封夹在案宗里的信之后，向下看，打开柜子取出手铐，手枪和证件。办妥这一切后，我去到MARK的办公室和他处世哲学说话，并把在我桌上拿到的案件档案交给他，转身离开。
　　SKIINNER在门外等着我，对我说了他的想法：“先调查MULDER和SCULLY住过的洒店。”于是，在我的PDA地图上出现了EVERETT区和其中的COMITYINN，选择这里，我的调查便正式开始。
comity inn ，washhington
　　到了COMITY INN，我向柜台的管理员亮出了fbi的证件，并和她谈话。谈完后，她便应我的要求，带我们到了mulker和scully住过的房间。在mulker的房间内，首先要看他床上的公文包。在里面可找到一份fbi的档案。接着便是ufo会报?the magic bullet。此外，我还查看到那些向日葵种子壳和橙色自制饮料。这一切都没有任何异样痕迹。在床头我找到一本有关外星人的书。检查完这边，我便去scully的房间。一进去，skinner马上和我说话，跟他罗嗦完后检查四周，找到一部属于SCCULLY的手提电脑和一本圣经，转向SKINNER，继续与他谈话:不知道那两个探员都打过哪些电话(按下左方的电话图示)。离开了此房间，回去找那名管理员。向她问及电话登记时她很不耐烦，但还是把电话号码给了我们。
　　取得了电话号码后，我们亦不作久留，启程回到办公室。从PDA上翻看笔记，并发出E-MAIL 。查看日志后，得知MULDER所打过的其中一个号码是（206）555 01182。于是我启动电脑，利用ING。输入电话号码，并选PHONE，再按下SEARCH按钮。经过查寻后，电脑找出了该电话号码的地址，是属于一间位于码头边的货仓。
　　取得地址后，想也不想，连同SKINNER，马上出发前往该货仓。
DOCKSIDE WAREHOUSE，SEATTLE
　　货仓门前，我利用开锁器把锁打开。那绝对是滥用职权的好例子，反正SKINNER也说就当他没有看见，进入货仓，我和SKINNER分头进行搜查。在阴暗的环境下靠从窗外渗入的光线，我看到地上有些异样。蹲下细看，竟然是血迹象！我取出了证物收集工具拿取了一些样本。在柱子上我又找到了一粒子弹头，同样利用证物收集工具把它取出。接著，我又在地上找到了一只“MORLEYS”牌的烟头。
　　我来到了SKINNER所在的房间，他对我说这里的电话已被切断了。我来到一条漆黑的楼梯前，点亮电筒，在二楼房间找到一支铁扳手后，回到一楼。在入口左方处放置的几个木箱要靠铁扳手打开。我发现里面储存着一些金属粒。我收集了一些样本，打算待会拿去给化验所看看。
　　从货仓的后门走了出来，我看到有一名渔夫正把船停在这里。我立刻下去并向他亮出证件。我向他问及所有问题，他都做了回答。但我一直觉告诉我，这个叫WONG的渔夫一定对我有所隐瞒。回到货仓，我和SKINNER谈及有关在货仓内所找到那些证物有问题。
　　既然在这里瞎猜没有用，我们决定离开。才一踏出货仓大门，SKINNER立刻对我说：有一辆黑色的车跟踪我们很久了。我鼓起了勇气，向那车走去，房车马上开跑了，但还是被我用相机拍下了他们的车牌号码。
king country office，seattle
　　回到办公室，我在回议室和skinner讨论起那些证物的问题，他却一直保持著中立的态度。而在问及他认为我们为何会被那黑色房车跟踪时，shanks突然出现并对skinner说要立刻返回dc总部，并吩咐我今晚监视货仓，他拿血液样本回去化验。
　　SKINNEER离开了，我回到办公室坐下来静心思索今天发生的事情。此时MARK会站在门边和我聊这案件。在离开前，MARK注意到那部属于SCULLY的LAPTOP电脑。这里会有一个分支，但是无论让他拿还是不拿，结果相同。如没让他拿走，我就要自已将SCULLY的LAPTOP放进了证物框里。
　　入夜了，我决定起行监视货仓。
DOCKSIDE WAREHOUSE，SEATTLE
　　在黑暗中等了一会儿，我看到驶来了一辆车停在货仓前。利用望远镜可看清，那辆正是之前跟踪我和SKINNER的车！我看着两名男子从车上搬出了一个黑色的箱子进入货仓内。待他们进了去，我马上跑到货仓的后门，利用开锁器开门进去。小心翼翼地，我看见两名男子打开了地上一个暗格，之后，拿了些东西出来，放进刚才他们搬入的黑色箱中，跟着便马上离去。我听着车子离去的声音，这才出去看看那暗格。发现里面竟是空的。我没有久留，决定回家。在PDA SEATTLE地区中选择APARTMENT回到了我的住所。
evrlvy apartments， sesttle
　　打开门进入后，我立刻来到了电脑前login进入fbi网络。利用photoviewer的功能，把拍下的照片从相机download下来。从那幅清析看到车牌号的照片中得到刚才跟中我们与及出现在货仓的那两车的牌号是240-eak。再利用inc，输入车牌号码，在vehicle plate number处按下。再选择government/military，之后再按search。得出来的结论竟然该资料是保密的。
　　原来以为这是很有用的线索，岂料找不到什么。也只好待明天看看从证物上可以找到什么吧。天色已晚了，今天一天工作很累，还是睡觉吧。
FBL FIELD OFFICE，SEATTLE
　　一清早回到办公室，MARK竟然躺在了走廊处，我马上走过去看他。他正好醒过来，手按着后脑，明显是被人击昏的样子。我问他是否有事，MARK缓缓坐了起来，回答说没什么大事。我的直觉便告诉我犯人的目标一定是证物室！我立刻走到证物室，打开那个大柜。果然如我所料，SCULLY的LAPTOP下见了！就在这时，电话突然响起。我跑回办公室接听电话。对方是D S化验所的人员。他告诉我，化验证明那是SCULLY的血！此事令我不禁担心起来。我挂断了电话，MARK就出现在门口对我说：“昨天我盘问过的那个渔夫，今天早晨被枪杀了。我觉得MARK的形为十分可疑。我要去看看WONG被杀的现场。
DOCKSIDE WAREHOUSE，SEATTLE
　　在货仓后面的码头，一名警员站在封锁现场界限内。我亮出了证件，随即走过去看了看WONG的尸体，又看了看他身边的东西。我向在场的法官询问问题，得知WONG是在今天清晨被杀的。而WONG并没是挣扎的迹象。之后我便来到一名叫ASTADOURIAN的女探员身边。她有点不信任FBL的人。这名女探员真利害，在我能问他她何问题之前，已经先问清了我的案件和一些她感兴趣的事。在问完所有问题之后，我们便一行去搜查WONG的渔船。我们发现WONG的船上没有任何用来储存渔获的装置。我进船仓内搜索，在右手面的床上，找到一件印有TARAKAN这样的风衣。回一外面，我问了ASTADOURIAN一些问题。就在这时，法医官说已准备好离开。ASTADOURIAN叫他当验尸官处理好验尸后再打电话给她。WONG盖着白布的尸体离开时，ASTADOURIAN告诉我海港官理人回来了。我下了船问了他有关WONG的东西并取得货仓拥有人的电话。最后，我问到有关TARAKAN的问题。原来TARAKAN是一艘俄罗斯人的船。在数个月前曾在海中突然失火。船上所有船员丧生。ASTADOURIAN这时叫海港管理人带我们去看看这艘TARAKAN。我亦一同跟着去了。
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　　海港管理人再一次告诉我们有关TARAKAN的事。他说船失火的原因至今未明，而船上只找到四具尸体，其余五具人尸沉大海。我发现这船好像只是外面被烧了，船仓内好像还是好好的。在海港管理人走了之后，我和ASTADOURIAN上船展开调查。首先在第二层外围的我看见了一些白色的人影印了在墙上。接着来到船仓内，我找到一本船员日记，一本帐簿。再来到船下的机房，我看到一箱箱印有鹰标志的箱。接着又找到一个看似是炸弹的金属球。上到最顶层的驾驶仓，我叫ASTADOURIAN跟我一同出外看看那些白影。而她说曾在日本广 见过这样的一幅墙，白影是在原子弹爆发的一刻把人影印了在墙上。回到驾驶仓，我再把搜集到的证据逐一交给她看。在看到帐簿时ASTADOURIAN说警察部门有人能翻译些广文字。我告诉她只要她和我分享翻译后的成果便没问题（回答：“THAT’S FINE ASSUMING YOU’ LLSHARE）。这时再看看柜上的手指标志，ASTADOURIAN发现在旧的指模上有一些新印上去的指模。于是我立刻致电JOHN，叫他来收集新的指模。
　　就在我收线后，一名探员来叫ASTADOURIAN前往验尸官那里。
KING’S COUNTRY MEDICAL EXAMINER’S OFFICE，SEATTLE
　　PDA SEATTLE地区CORNER’S OF-FICE。推门进内，验尸官对我们说WONG身上长满了不同类型的癌细胞。以他的病况而论一定痛不欲生。一定要靠大量药物来抑制痛楚。而且，能做成这样的原因是有可能曾暴露过在大量幅射当中。在向她问问题前，我先收集了在铁盘上的弹头。在向她询问了所有有关问题后，我提到了TARAKAN丧生船员的尸体！竟发现尸体被人盗走了！同样是满脑子疑团的我和ASTADOURIAN作起了假设来。我同意她的假设，我发现似乎找到了新的合作伙伴。
KING COUNTRY CRIME LAB-SEATTLE
　　离开了验尸官那里，我又来到了证物化验所。我把证物交给JOHN，顺便询问他有关TARAKAN上的指模。他说已取回了样本，待会便会处理好。
APARTMENTS SEATTLE
　　返回家中，我打开电脑，刚好收到JOHN的E-MAIL。在E-MAIL内附加了一个档案，我按下了那个万字夹图型，选取FBI的DATABASE，赫然发现那竟是MARK的手指模！
　　此时突然响起了敲门声，我立刻去应门，来人正是MARK！他一走入来，二话不说，立刻走到窗前拉开百叶窗的小缝看出街外。我问他话，谁知他竟恶人恶语，选择回应方式：ANGRY（发怒）；PEACEFUL（平静）；INDIGNANT（不忿）。 听到我的回应，MARK会冷静下来说话。说罢，他就离开了。
　　我再次到仓库监视，发现一辆卡车停在那。进卡车驾驶室，在遮阳板下会有发现。取走印有RR#1211&82434的字条，赶紧从另一侧车门逃出。卡车开走后回住处。用计算机查阅字条上的地址后，去睡觉。不久，ASTADOURIAN会来拜访，和她说话并看她的录像带，这时会有两份传真从外面发这来。看完后，给ASTADOURIAN看，再和她谈话。最后，我们打算到CORONER的办公室看看CORONER’S OFFICE 办公室所在的院门没有锁，我们直接就走了进去。和ASTADOURIAN交谈后我们来到办公室中，找到一把钳子和一支铁锹。我看到地上有些废纸，从中找到一个帐本，我正要看时，黑暗中闪出一个人，把我和ASTADOURIAN打倒在地后将我们锁在了屋中。
　　ASTADOURIAN发现这个屋子已经被装上了定时炸弹，千万不要试图用钳子去拆弹，会死人的。用铁锹打破门下面的透气窗，从中钻出即能逃脱。出门后我和ASTADOURIAN谈论这次事件，并用PDA 将进展汇报给SKINNER和SHANKS。我和ASTADOURIAN分手后回到了住处。我突然想起该到验尸官那儿去看看。与验尸官谈论过所有的问题后我就回家睡觉了。
FIELD OFFICE
　　一觉醒来后我又回到了办公室，在会议室中遇见了MARK，他交谈后一起出发到SMOL仓库。在这里让MARK 掩护我 ，在一层杀掉了三个持枪歹徒，找到一个帐本，上楼过程中又消灭了两个歹徒。上到顶层后发现靠窗处有一个螺旋楼梯，下去后见到SMoL。与他说过话后再下到一层找到一支歹徒曾使用过的手枪。再次和SMOL与MARK谈话后来到了试验室。
CRIME LAB
　　JOHN测试过那支枪后，我又回去和SMOL谈话。在这之后MARK会将SMOL带回去。这时电话铃响了，是JOHN来的电话。接听过电话后我回了家。回家后ASTADOURIAN来找我，她冲我发了一顿火，听一下电话留言，她走后查看一下E-MAIL。处理完文件后我就上床睡觉了。起床后我应邀到SAND POINT继续调查。
SAND POINT
　　在大厅边上的小屋里，会有一个黑人出现。和他说话可要小心，搞不好会没命的。但如果顺利，他会给我一把匕首。待他走后，ASTADOURIAN出现了。同她谈话后，我们一起去医院。
HOSPITAL IN GOLDBAR
　　面对护士，我们出示了我们的证件，还要告诉她SKINNER是我们的上司。问完所有的问题后，我们就进了SCULLY的病房。和她说话后，出示刚从黑人那得到的匕首。她会变得很合作。谈话结束后，我和ASTADOURIAN去RR1121处。
RR1121 火车站
　　此处是火车站的列车停放区，开始时顺着两列火车之间的通道一直往前走，爬上一个电线杆，视野右转一下，取出望远镜，一节银白色的车厢顶上写着“82434”五个数字。下来之后我要去那节车厢去看一看，可以右转，前进一步，再右转，走两步，就到了那节车厢。先观察它，再打开门进去，和ADSKINNER说话，转身由她身后的门出车厢。下车后遇到一个流浪汉，和他做一个对话游戏：（1）THERE BEEN A FIREIN A BOXCAR-；（2）PHOTOGRAPHS；（3）MOVING PICTURES；（4）VIDEOTAPE。即使回答对了，流浪汉也不会白白给你。得到VIDEOTAPE后，点击PDA，查看电子邮件有关“BOMB”的那一篇，再给SKINNER和SHANKS发一个E-MAIL，坐车回办公室。
FIELD OFFICE
　　把VIDEOTAPE放进计算机，查找录像中的医生，ING画面中选择SEARCHDATABASE下的 GOVERNMENT/MILITARY项，找到后再与VIDEO CONFERENCE联系，随便与他们交谈，我可以练习听力了。过场影片后，查看新的电子邮件，其中一封会指引你去ALASKA。
ALASKA之旅
　　在ALASKA之旅的第一件事：我们先要去RAUCH’HOUSE解救MULDER。走进木屋，找到楼梯上到二楼，一具死尸躺在地板上，，观察屋中挂的一个小骷髅饰品，拉动它。由顶楼暗格下来一个梯子，上去见到MULDER，与他谈话中SCULLY也打电话过来。
　　两人刚要走时，NSA的两个匪徒出现在楼外，要干净利落的干掉他们：下楼，掏枪，由客厅的正门出去，左转身先射死瘦的，再打掉那个开枪慢的胖子。开车直奔基地而去。