之后小川勘兵卫出现，并召唤三头妖蟒，进入机翼战第二阶段，主要还是在快速灭火跟打倒感染体，跟第一阶段没啥分别；在第二阶段的最后，要打三头妖蟒其中一个头，拆掉他的硬壳后用猎鹰双刀猛打就是了，他只会用头不断往前冲咬，注意闪躲就能轻松攻略。打倒妖蟒后进入机翼战第三阶段。

    第三阶段要特别注意：收起你的猎鹰双刀跟旋风手里剑，改用破岩刀应战。这样做的理由并不是因为敌人带著盾上场，而是怕不小心让箱子还没破就飞出机舱，让珍贵的宝物也付诸流水…

    第三阶段要破坏25个箱子，来阻止飞机坠落，在刚进场景时左手边的箱子里就有一件服装：小丑。打到机舱后端，内侧的箱子有一枚生命碎片，千万不要不小心把箱子吹出机舱外，不然就要重打一次啰…

    箱子破坏完后，要先面对两架生化直升机，打法没啥改变，反弹他的导弹到他摔到机翼上，然后拔出猎鹰双刀解决他吧！

    接下来是三头妖蟒的另一个头，这次多了会爆炸的小虫在旁边干扰，除了注意自己的HP之外，还要注意飞机的HP。建议以猎鹰双刀搭配旋风手里剑进行攻略，超忍力并没有太大帮助，且会造成忍力的消耗并受到较大的损伤，不是很建议在这一战使用。

    打完后进入最后头目：三头妖蟒的核心。他的攻击方式如下：
★ 用嘴发动嘴炮…呃…是发射电球，但被击中不会被麻痹。
★ 用之前被击败的两个头发动火球、冲咬等招数。

    由于他的头会摆来摆去，近距离很难造成有效率的伤害，建议让猎鹰双刀升级到三级，按RT+Y键连打，这样猎鹰双刀会带著小川剑像直升机一样飞起，并给予广范围的攻击。超忍力在这一战就比较重要了，抓对时机使用的话，这王也不难打。

    打完妖蟒后，就会进入QTE，玩家可以在这个时候看到忍者是怎么让飞机迫降的…(汗)。随著飞机安全降落，第四章也在此划下句点啰！