《武侠群英传2》的功体系统
《武侠群英传2》对主角人物的设定中引入了功体系统，表征人物天生的根骨状况，包括烈、旋、震、凝、天、魔六种。不同的角色各有各自的优势方面。另外，各功体之间也隐含着克制关系。最明显的就是影响武功的修习。
游戏中秘传也分烈、旋、凝、震、天、魔六系，而要学会每一套武功都必须将功体修行到一定的数值才行，玩家可以培养一个只专精于旋系武功的楚留香，也可以培养一个修双系、乃至三系武功的楚留香，但武功博杂的情况下，就无法精通。
引入奥义、合体
战斗系统引入了新的奥义、秘传、合体技等等新的种类。奥义概念类似于格斗游戏中的必杀技。而合体技是两个特定角色组合奥义的衍生，与奥义相比，合体技的威力更大。而当会使用合体技的两人，排序是依照行动顺序，且满足罡气值的条件。
在回合制的基础上加入了战斗跑位系统，人物在每完成一回合攻击动作之后，就会随机在战场中做相应移动，玩家也有机会从被破坏的场景设施中得到隐藏的道具。
上百种合成技能
前作中允许合成的技能多达五十多种，而到了《武侠群英传2》的世界里，这些技能的组合数量将会多达上百种。更多威力惊人的技能需要调配组合才能使用，游戏里将会出现更多种强力技能，根据自己喜好自由组合这些技能，将带给玩家完全自己做主的游戏乐趣。
武器打造系统在二代由于新角色的加入，可以打造的武器也会有所增加，且武器附带的攻击效果也会有所增加，甚至有必须利用锻造后的武器，才能够打败后来登场的强大BOSS。
怪物集中营，合成图鉴乐趣多
出现的怪物种类和数量将会远远超越前作，除了前作登场过的怪物，更多新亮相的怪物和BOSS将会让玩家眼前一亮。而遭遇怪物或BOSS进入激战后，趁机打掉敌人身上携带的私有物品，接着前往寻找游戏世界中特定的NPC，还能马上合成出漂亮的怪物图鉴收藏。
在一代的基础上独创了“宝箱幻化”的新玩法。在游戏的最终迷宫里，探险的玩家将会遇到没有宝箱可寻的困境，此时玩家只要仔细寻找就可以在迷宫中找到一种名为“精元”的元素，并且在迷宫的深处会隐藏着数个幻化点。将精元丢入幻化点中进行道具幻化，就会得到各种各样的宝贝，而精元的数量将会影响到宝贝的种类和质量。而这未知物质的神秘谜团就等着玩家自己解开。
每个角色都有其独特的功体属性，必杀技奥义心法、合体技攻击战术，更高段、多种类的技能提升，都使得装备属性更多样化。而一代中大获好评的卡片系统及武器锻造系统，都会在二代获得延续，玩家可以亲手打造一把神兵利器，好闯荡这浩瀚江湖。此外，一代中最大特色的网络任务也会获得大量扩充。可别以为解完单机任务游戏就此结束，上百种环环相扣的网路任务等玩家来解谜，绝对能够再一次体验无尽的江湖冒险之路。