鬼神之门2在上一集中，对李玄和吕洞宾故事有所交代，并对最终BOSS梦魔进行了交代。在新在一集当中仍将继续原来的故事，将主角定位在何仙姑和韩湘子。并在故事进行中途，将第一集中人物李玄和吕洞宾引入。整个故事也因此逐步展开，在此更加突出在鬼神世界的背景下，铁面人、梦、持有“魂之石”的人们之间特有的命运、情感！
　　《鬼神之门2》游戏攻略
　　何仙姑
　　这一日，倾城何家大办婚典，何家大小姐何仙姑与母亲在家里等候双狮镇韦家少爷韦如风来迎娶。然而家丁二卞进屋交给何母的却是一纸退婚书。归楚怡安慰何仙姑，这已是何小姐第七次被拒婚。二卞扬言要踏平韦家走出何家。归楚怡要何仙姑跟着二卞，要他不要生出事端。
　　二卞来到双狮镇韦如风家找其理论，与韦如风正要开始战斗，何仙姑赶到，韦如风只说在前往福鼎山祈神之后就这样决定了，因此何仙姑与二卞决定前往福鼎山。
　　在福鼎山明观外，不知为何何仙姑十分害怕听到答案。二卞一人进入福鼎山明观帮何仙姑询问。这时一小道人从山下上来，见何仙姑问哪里才能找到何仙姑，何仙姑说自己就是，这时二卞与明观道人一起从明观中走出来。明观道人以为何仙姑是传说中的神仙再世，而韦如风他们正是何仙姑误以为神仙下凡，因此不敢渎神。小道人正是明观道人派出来寻访何仙姑的，何仙姑否认自己是仙人下凡。与二卞一起匆忙离开福鼎山。
　　何仙姑回到倾城问母亲为何将自己取名为何仙姑，母亲要二卞离开，正要回答的时候，铁面人出现将何母杀害。何仙姑母亲临终前交给何仙姑一个魂之石，要何仙姑去找彩虹仙子。
　　到双狮镇后山，何仙姑、二卞碰到了彩虹仙子，但彩虹仙子被人偷走了一种绿颜色，所以通往彩虹之里的道路没有办法搭建，需要何仙姑到倾城找到小偷。
　　在倾城小偷贝飒家，贝飒将绿色点缀在自己家中，乐在其中。一场战斗何仙姑夺回绿色，回双狮镇后山，将绿色还给彩虹仙子，彩虹仙子搭起彩虹桥，何仙姑与二卞进入彩虹之里。彩虹仙子说彩虹之里会将所有人的愿望都化做美丽的彩虹挂在天上。
　　在彩虹之里，打败铁面人后，见到的居然是作为铁面人的归楚怡。原来何母原本是一个拥有魂之石女铁面人，接受幻魂的指令来到彩虹中破坏人们美好的愿望，但是却与彩虹之外的人相爱，因为她看到那时的何父的美好愿望，不忍心破坏，并与之相爱，生下一个孩子，这时幻魂来了，如果何母继续铁面人的话，就不能要孩子，如果要孩子，就不能再做铁面人，因为所有的彩虹中的人都是来自虚无的。何母决定离开彩虹，但是这个孩子却被幻魂者指定名为何仙姑，而且这个秘密如果何母想要告诉给任何人包括何仙姑的话就必须得死。那天何母不忍心何仙姑被人误会仙人下凡而找不到自己应有得幸福而想把事实得真相告诉何仙姑。就被幻魂发现而派遣铁面人加害。何母说自己是来自于虚无的。既然是虚无的，生与死又有什么区别。所以要何仙姑不要为自己报仇。
　　彩虹仙子与何仙姑与二卞决定去明观说明事实，彩虹仙子向明观道人做证何仙姑不是现任下凡。
　　以前那些退婚的人，听说何仙姑并不是仙人再世都要与她恢复婚约。而且韦如风与众人为这件事竟争执起来。得知自己生世的何仙姑反而更加痛苦了。这时吕洞宾、李玄由于感应到了何仙姑魂之石，来到何仙姑家。他们都拥有神仙的名字，吕洞宾说自己在百年轮回之前也是用同样的名字，这究竟是怎么一回事。李玄与吕洞宾没有关于父母的回忆，唯一的办法是要何仙姑鼓起勇气去寻找其自己的父亲。
　　吕洞宾、李玄、二卞、何仙姑回到了彩虹之里，回到在何母与何父分手的时候，原来答应何母离开梦乡脱离铁面人身份的真正原因是何父答应放弃现实代替何母成为铁面人，为了爱人与女儿，何父甘愿今后不再相见。
　　而一直追踪何父幻魂的幻魂出现了(玩家因该还记得在第一刊中出现过的幻魂吧)，当幻魂问何父是否后悔的时候，何父说并不后悔，因为他是这样忘我地爱着自己妻子与女儿，什么都是可以虚无的，但是爱是真实的。何仙姑正要救自己的父亲时，但却无法接触因为那知识彩虹凝聚的幻象。何仙姑、吕洞宾、李玄、二卞在彩虹之里找到幻魂打败它，但是幻魂至死不说明神名的缘由。
　　韩湘子
　　方城的寰宇大戏院正在演戏，韩湘子买票进去看。戏未开演，就有人上台搅局，韩湘子打败搅局的人柯德。戏班师父涂景十分感谢并欣赏韩湘子的武艺，要韩湘子留在戏班，韩湘子婉言谢绝了。涂景问韩湘子家住哪里韩湘子如实告知。戏开演了，女主角秦霏的出现令韩湘子后悔为何没有答应涂景。看完戏后韩湘子离开戏院。途中得知戏班将去磊石村自己的家中演戏。
　　回到家中韩湘子向韩仲吉提出要去戏院演戏，被韩父训斥一番，韩家本是贵族，但是家道早就中落，韩家便迁往磊石村。韩湘子的父亲要韩湘子在磊石村安静念书，希望将来可以光宗耀祖。但是韩父却很喜欢看戏，训完韩湘子后就要韩湘子在家好好念书，自己却偷偷溜出家中看戏。
　　村长来韩家找韩湘子的父亲，韩湘子带村长来到村中戏台前，村长要向韩父索回被借去的住所。韩湘子上前帮父亲说话，戏班涂景见此情景向村长为韩父担保。但是正好有一演员生病无法出演，涂景又提出要韩湘子加入戏班。韩父不好意思阻止，便自告奋勇顶替出演。韩湘子气得回家去读书了。
　　韩父出演完毕，回家大呼过瘾，因为他在剧中扮演的正是一个贵族。他仿佛又重新回忆起韩家辉煌的过去，不再阻止韩湘子去演戏，因为他可以让儿子体验到自己的家族曾经拥有怎样的荣耀。
　　韩湘子来到村中戏台前，戏班刚刚离开去同林寨演出了，韩湘子在路上追上戏班。并自告奋勇先上上同林寨踩踩道，涂景就将一枚魂之石给他，秦霏和她一块前往。韩湘子、秦霏打败山大王后，山大王同意戏班在同林寨演出。
　　韩湘子与秦霏回到方城寰宇大戏院，涂景没有让韩湘子演戏而是要韩湘子去加蒙矿山踩道。韩湘子、秦霏在加蒙矿山打败矿山督长，矿山督长同意戏班在加蒙矿山演出。
　　韩湘子与秦霏回到方城寰宇大戏院，涂景还是没有让韩湘子演戏又让韩湘子去大牧场踩道。韩湘子、秦霏打败牧场主，牧场主同意大牧场在同林寨演出。
　　终于，涂景同意韩湘子演戏了，这一次他所演的戏是《复仇》，涂景把剧本给秦霏和韩湘子，让他们休息一下先熟悉剧本。秦霏和韩湘子到方城宿屋休息，在方城大街上遇到吕洞宾、李玄与何仙姑，三人询问韩湘子魂之石的事情，但韩湘子只是想着演戏不理会三人的劝说，和秦霏回方城大戏院开始演戏。
　　在戏中，韩湘子为父报仇把仇人杀了，当他演完这出戏后，便听见涂景的哈哈大笑声。接着便是黑屏。当他睁开眼时，突然发现身边有许多人影在周围旋转，有矿工、牧民与强盗他们说他们也是因为演戏之后才来到这里的，当然还有秦霏，这个黑暗的地方，一切都只是在旋转。韩湘子知道真相后，决定不再演这出戏了。黑暗过去后，韩湘子回到了舞台，这时李玄、吕洞宾、何仙姑也已来到了戏院。
　　韩湘子第一次看戏时曾经前去搅局的人柯德走了进来，他说涂景本来是要将人都毁灭的，但是他发现只要将人的善良全部夺走，也有一样的效果，所以他创立了戏班，专门上演恐怖血腥的剧目，只要人们熟悉了恐怖血腥也就会对生命漠视了。这时涂景从后台出来，邪恶最终被正义战胜，涂景倒下了。